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TS - SVT - Programmes - Ressources
Enseignement spécifique et de spécialité

Nouveau programme rentrée 2012
TS 2013 - SVT - RESSOURCES ÉDUSCOL

Le principe de liberté pédagogique
En application de la loi n°2005-380 du 23 avril 2005 d'orientation et de programme pour l'avenir de l'École, «la liberté pédagogique de l'enseignant s'exerce dans le respect des programmes et des instructions du ministre chargé de l'Éducation nationale et dans le cadre du projet d'école ou d'établissement avec le conseil et sous le contrôle des membres des corps d'inspection».
Les programmes sont, en conséquence, la seule référence réglementaire adressée aux professeurs. 
Les ressources et documents proposés aux enseignants garantissent ce principe, il revient à chaque enseignant de s'approprier les programmes dont il a la charge, d'organiser le travail de ses élèves et de choisir les méthodes qui lui semblent les plus adaptées en fonction des objectifs à atteindre.
Les ressources pour faire la classe proposées par la DGESCO ne sont que des appuis à la libre disposition des professeurs.

Introduction

Les programmes de lycée s’organisent, de la seconde à la terminale S, selon un certain nombre de principes généraux :
Une place importante laissée à la thématique de l’évolution. Il s’agit, selon les moments, soit d’un sujet d’étude en tant que tel, soit d’un outil explicatif indispensable pour comprendre la biologie en général.
La volonté d’associer dans la motivation des élèves les intérêts scientifiques fondamentaux et les préoccupations personnelles plus appliquées. C’est ainsi que les trois grandes thématiques qui organisent l’écriture du programme déclinent trois motivations :
la science et l’envie de comprendre pour le thème « la Terre dans l’univers, la vie et l’évolution du vivant » (avec, en plus de la préoccupation culturelle pour tous, une perspective vers l’univers-métier de la science elle-même) ;
l’environnement planétaire dans une perspective de développement durable pour le thème « grands enjeux planétaires contemporains » (avec, en plus de la préoccupation culturelle pour tous, une perspective vers l’univers métier de l’aménagement et de la gestion de l’environnement) ;
le propre corps et la santé pour le thème « corps humain et santé » (avec en plus de la préoccupation culturelle pour tous, une perspective vers l’univers-métier des professions de la santé).
Le souci de rendre plus stable que par le passé la maîtrise des fondamentaux au sortir du lycée. En terminale S, classe où la spécialisation de l’élève se marque plus nettement, le programme de SVT vise à assurer une construction solide des concepts scientifiques sans chercher à l’exhaustivité des connaissances actuelles sur le sujet. Les thématiques choisies, comme les orientations du programme s’inscrivent dans ce projet, en s’appuyant sur les acquis de seconde et première dans l’optique de préparer au mieux l’orientation post baccalauréat des élèves.
L’unité du programme de lycée comme un projet conçu sur l’ensemble du curriculum, du moins pour ceux des élèves engagés dans la filière scientifique, est marquée par une partie du préambule qui sera identique pour les trois années.
L’affirmation de l’ouverture de la discipline sur les autres champs de connaissance, scientifiques ou non.
Fin de l'introduction




Thèmes et sous thèmes



 La présentation des Thèmes et sous thèmes :




Thème 1 - La Terre dans l'univers, la vie et l'évolution des êtres vivants

Première source de motivation des élèves pour associer les intérêts scientifiques fondamentaux et les préoccupations personnelles plus appliquées : la science et l’envie de comprendre pour le thème « la Terre dans l’univers, la vie et l’évolution du vivant » (avec, en plus de la préoccupation culturelle pour tous, une perspective vers l’univers-métier de la science elle-même).

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive
  • Thème 1A -Génétique et évolution
Sens général du thème (problématique) : Comprendre la diversité génétique source, mais pas seule, d’une diversification des êtres vivants base de l’évolution. Compréhension permettant d’interroger le concept d’espèce, le cas de l’Homme et celui particulier de la vie fixée chez les plantes.

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive
  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive



  • Thème 1A1 - Le brassage et sa contribution à la diversité génétique
  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 1A1 - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 1A1 - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 1A1 - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive

 Acquis à mobiliser
Les notions suivantes ont été abordées dans la scolarité antérieure des élèves :

• Chromosome constitué d’ADN, support de l’information génétique.
• Gène – allèle – notion de dominance / récessivité au niveau cellulaire et macroscopique.
• Caryotype identique pour tous les individus d’une même espèce.
• Caryotype identique pour toutes les cellules de l’organisme (sauf pour les cellules reproductrices).
• Existence dans chaque cellule de paires de chromosomes portant les mêmes gènes mais pas forcément les mêmes allèles (donc génétiquement différents).
• Maintien du nombre de chromosomes lors de la reproduction sexuée : séparation des paires de chromosomes lors de la formation des cellules reproductrices (qui ont donc un seul chromosome de chaque paire) et reconstitution de paires de chromosomes lors de la fécondation.
• Production, par un même individu, de cellules reproductrices génétiquement différentes expliquée par la répartition au hasard des deux chromosomes de chaque paire.
• Unicité de chaque individu issu de la reproduction sexuée.

Les nouvelles notions à bâtir
  • Les notions de brassage intrachromosomique et de brassage interchromosomique lors de la formation des gamètes en relation avec le déroulement de la méiose.
Remarque : 
Les termes de chromosomes homologues, de méiose et de brassage chromosomique n’étaient pas au programme des années antérieures, et seront donc à introduire.
  • L’unicité génétique de chaque zygote, unicité résultant des brassages chromosomiques ayant lieu lors des deux phases clés de la reproduction sexuée (méiose et fécondation) : « chaque zygote contient une combinaison unique et nouvelle d’allèles »
  • La notion « d’anomalies chromosomiques : origine, conséquences, source de diversification »... pouvant survenir lors du déroulement de la méiose (origine) et leurs conséquences pour l’individu (trisomies, …), mais aussi en terme de source de diversification du vivant (apparition de nouveaux gènes; familles multigéniques).
Quelques pistes pédagogiques

Piste pédagogique 1 : faire le point sur la stabilité des caryotypes :

Il s’agit ici essentiellement de mobiliser les acquis des classes antérieures (cf.point1.1.1Ressources éduscol).

Cette mobilisation peut prendre des formes variées :

- Schémas à compléter et/ou à ordonner.
- Arguments à extraire de documents et à mettre en relation pour justifier cette stabilité du caryotype.
- QCM sur documents... etc

Cela peut aussi être l’occasion de réaliser une évaluation diagnostique : il s’agit d’une évaluation d’un type particulier, qui ne donne pas lieu à une note, et qui poursuit plusieurs objectifs : faire le point sur les acquis, les représentations des élèves, et poser les problèmes qu’il reste à résoudre.


Exemple de piste pédagogique 1 :

A- Des observations et une étude de documents : une situation motivante
  1. Des observations réalisées dans un élevage issu de la reproduction sexuée (prendre soin de porter les observations sur des élevages où il existe une certaine diversité génétique)... 
  2. ... Accompagnées de documents... présentant les caryotypes des parents...
  3. Et les caryotypes des petits... 
B- Une première exploitation des observations et des documents est l’occasion, dans un premier temps :
  1. De constater la conservation du caryotype au cours de la reproduction sexuée...
  2. De mobiliser les acquis (cellules reproductrices, fécondation, complémentarité du mécanisme de formation des cellules reproductrices et de la fécondation, …).
  3. Et d'introduire le terme de MÉIOSE.
C- Une seconde exploitation des observations et des documents est aussi l'occasion, dans un second temps :
  1. De constater la diversité des descendants (rappel : on aura pris soin de porter les observations sur des élevages où il existe une certaine diversité phénotypique),
  2. de mobiliser certains acquis (gènes, allèles, caractères,...)
D- Le résultat des deux exploitations permet de :
  1. Constater que les caractères sont brassés... et donc de poser la notion de brassage : ici il s’agit de brassage de caractères, donc brassage au niveau du phénotype macroscopique...
E- Un questionnement peut être soulevé et donc une problématique peut être dégagée. Elle permet de :
  1. S’interroger sur les mécanismes qui permettent ce brassage macroscopique des caractères...,
  2. donc sur le brassage des chromosomes...,
  3. et donc sur le brassage des gènes.
F- Dans le prolongement de cette évaluation diagnostique, on peut aborder l'étude de documents sur le déroulement de la méiose et de la fécondation pour poser les phénomènes cellulaires et chromosomiques :
  1. Des documents pour le déroulement de la méiose (puisque le terme a été introduit) : on étudie les différentes étapes, mais sans faire d'analyse en terme génétique... 
  2. Des documents pour le déroulement de la fécondation.
G- Suite à l'étude de la méiose et de la fécondation, les phénomènes cellulaires et chromosomiques ainsi posés permettent de dégager une problématique qui pourra être utilisée lors de l’étude suivante sur le brassage chromosomique et allélique, par exemple :
  1. Comment est assuré le brassage chromosomique et allélique ? (source de diversité des caractères macroscopiques)
Piste pédagogique 2 : aborder la notion de brassage génétique lors de la reproduction sexuée :
  • Le déroulement de la méiose pourra être établi dans ses grandes lignes à partir :
- d'observations microscopiques...
- réalisées en articulation avec la visualisation de séquences vidéos et/ou d’animations.
  • La notion de brassage lors de la méiose pourra être abordée à partir :
- D'analyse de résultats de croisements de type « TEST-CROSS ».
- Résultats : les phénotypes des descendants d'un croisement de type "TEST-CROSS" renseignent directement sur le génotype des gamètes produits par le parent hétérozygote.

- Important : pour que l’analyse des résultats du test-cross puisse réellement se faire en relation avec l’objectif fixé (comprendre l'origine du brassage des caractères macroscopiques), s’assurer que les élèves ont bien compris l'intérêt de ce croisement type "test-cross" : c'est-à-dire que la notion suivante doit être bien stabilisée chez l'élève : "les phénotypes des descendants d'un croisement de type "TEST-CROSS" renseignent directement sur le génotype des gamètes produits par le parent hétérozygote".
  • Une fois cette notion bien stabilisée, il faut maintenant parvenir aux notions de brassage intrachromosomique (prophase 1 de la méiose) et brassages interchromosomiques (anaphase 1 de la méiose et fécondation).
- Pour cela, il est possible de placer les élèves en situation de pratiquer une démarche d’investigation en relation dans un premier temps avec la méiose, particulièrement intéressante s'ils travaillent en ateliers.
- Pour mettre en évidence le brassage intrachromosomique au cours de la prophase 1 de la méiose, l'idéal serait de parvenir à leur faire imaginer le phénomène de crossing-over, en procédant par exemple de la façon suivante :
- L’analyse statistique des résultats de différents croisements de type test-cross (voir le site Statistix (http://www.statistix.fr/)...
- pourra être l’occasion de représenter le comportement des allèles en relation avec celui des chromosomes lors de la méiose (schémas, manipulations de maquettes, …).

Il serait particulièrement intéressant, pour leur formation, que des élèves s’interrogent sur :

- des résultats qui ne correspondraient pas à leurs attentes,
- des résultats qui ne leur sembleraient pas « logiques »,

Et que des informations complémentaires (figures de chiasmas en prophase I de méiose), fournies au moment opportun :

- Leurs permettent d’imaginer le phénomène de CROSSING-OVER...

- Pour cela les élèves peuvent étudier un document de figures de chiasma visibles en prophase 1 de méiose, accompagné soit d'un document indiquant le résultat d'un croisement test aux pourcentages de parentaux supérieurs aux pourcentages des recombinés, soit d'observation d'élevages (ou de cultures) donnant en réel ces pourcentages inattendus.

- L'explication de l'élève sera réussie lorsqu'il aura compris d'une part l'existence de crossing-over, d'autre part que les gènes, dans ce cas précis, sont situés sur le même chromosome, autrement que ces gènes sont liés.

- Les résultats inattendus (précédemment) trouvent alors leur explication dans le fait que des échanges de matériel ont lieu entre chromosomes homologues au cours de la prophase 1 de la méiose et que, dans le cas de gènes liés, ces échanges génèrent d'une part des individus au phénotype macroscopique de type parental, d'autre part des individus issus de crossing-over, donc d'une recombinaison, individus "recombinés" au pourcentage inférieur à celui des individus types parentaux.

- Les élèves sont donc amenés à comprendre le brassage intrachromosomique réalisé en prophase 1 de la méiose, donc de répondre en partie au problème posé par le brassage des caractères macroscopiques observés précédemment.

- Autrement dit, une réponse partielle au problème peut être annoncée :

"Le brassage des caractères macroscopiques observés dans l'élevage (ou la culture) précédent(e) est expliquée (en partie) par les crossing-over réalisés au cours de la prophase 1 de la méiose".

- Mais ce n'est pas tout : les élèves doivent comprendre également qu'un brassage interchromosomique est réalisé au cours de l'anaphase 1 de la méiose : la démarche d'investigation doit être poursuivie... Pour cela :

- Faire, par exemple, une analyse statistique portant sur les résultats d'un croisement-test entre un individu double hétérozygote (deux caractères étudiés portés par des chromosomes différents) et un individu double homozygote.
  • Dans un second temps, on poursuit la démarche d'investigation en relation avec la fécondation
- Les conséquences génétiques de la fécondation pourront être abordées en cohérence avec les conséquences génétiques de la méiose, dans le contexte de l’étude de croisements au sein d’un élevage ou d’une culture par exemple, de façon à bien mettre en évidence le phénomène d’amplification du brassage interchromosomique ayant lieu à la fécondation par rapport au brassage ayant lieu lors de la méiose. Ce phénomène d’amplification concourt à la grande diversité, voire à l’unicité, des individus issus d’une reproduction sexuée.

Remarque :
Dans toute cette phase de travail sur des résultats de croisements et d’analyse statistique, il est opportun de se rapprocher de l’enseignant de mathématiques afin d’établir une cohérence entre les notions abordées dans les deux disciplines (croisement entre la combinatoire génétique et la formalisation mathématique). Des ressources intéressantes sont disponibles dans ce domaine sur le site Statistix (http://www.statistix.fr/).

Piste pédagogique 3 : aborder la notion d’anomalies lors du déroulement de la méiose et leurs conséquences :
  • Anomalies caryotypiques et conséquences pour l’individu : les élèves ont découvert au collège l’existence de certaines anomalies caryotypiques dans l’espèce humaine (trisomies essentiellement). Il a été établi que ce nombre anormal de chromosomes empêche le développement de l’embryon ou entraîne des caractères différents chez l’individu concerné.
Piste pédagogique 4 : il reste maintenant à expliquer l'apparition de ces anomalies.

Un travail en atelier dans le cadre de la pratique d’une démarche d’investigation et/ou de résolution de tâche complexe est particulièrement approprié pour cette étude.

Des exemples différents pourraient être proposés à différents groupes d’élèves au sein de la classe, chaque groupe étant chargé de trouver et de présenter les mécanismes à l’origine de l’anomalie qu’il a étudiée, comme le ferait un médecin chargé de fournir des explications à un couple concerné par ces problèmes.

Remarque :
L’étude de différents cas de trisomie 21 (cas avec un chromosome 21 surnuméraire – cas avec une translocation) peut être intéressante pour préparer à la découverte de la notion de duplication.
  • Anomalies à l’origine de duplications géniques et conséquences en terme d’évolution : la découverte du phénomène de duplication génique doit être nécessairement replacée dans un contexte évolutif.
Cette étude pourrait tout à fait trouver sa place dans le cadre de l’étude du thème 1-A-2 « diversification génétique et diversification des êtres vivants ». Elle peut constituer une liaison entre les thèmes 1-A-1 et 1-A-2.

Plusieurs approches pédagogiques sont envisageables :
  • Soit présentation des phénomènes en s’appuyant sur des docs scientifiques et/ou des animations :
- Crossing-over inégal à l’origine d’une duplication génique
- Puis... devenirs possibles des duplicata et notion de famille multigénique.

Ces phénomènes étant maintenant connus, il est possible de :

- Soumettre aux élèves des exemples concrets de familles multigéniques... avec pour objectif de reconstituer « l’histoire génétique » de cette famille.

- Différents groupes peuvent travailler sur des exemples différents... :

Famille où les gènes codent pour des protéines ayant conservé un rôle similaire,
Famille où les gènes codent pour des gènes aux fonctions très différentes, …

- Une phase de mutualisation sera l’occasion de souligner l’importance de ce phénomène de duplication génique, ayant pour origine une anomalie de la méiose, en terme d’évolution du vivant.

- Selon le niveau de la classe, on pourrait aussi proposer à certains groupes un travail qui porte d’une façon plus générale sur la notion de « bricolage moléculaire » (travail sur des exemples d’homologies partielles de certains gènes qui illustrent le fait que des gènes peuvent être constitués de fragments de plusieurs autres gènes), ou encore sur l’existence de pseudogènes dans l’ADN non codant.
  • Soit résolution d'une tâche complexe : les élèves disposent de plusieurs documents... :
- Définition d’une famille multigénique.
- Document présentant un mécanisme de duplication génique.
- Données sur des gènes d’une même famille et outil de comparaison de séquences.
- Documents précisant le rôle dans l’organisme des protéines codées par les gènes.
- Document présentant les gènes présents chez différents organismes ayant des relations de parenté,…

... et utilisent ces documents pour :

- Argumenter du fait que « des anomalies survenant au cours de la méiose peuvent être source de diversification du vivant ».

Remarque :
Au terme de cette étude, c’est la notion de plasticité du génome qui peut être dégagée, en lien avec l’étude du thème suivant.

Ressources - Bibliographie

C. Karp. Biologie cellulaire et moléculaire – Concepts et expériences. 3e édition ed. De Boeck , 2010

Ouvrage pour la mise à jour des connaissances et illustrations (photos, schémas).
Une synthèse particulièrement complète des connaissances actuelles sur l’organisation et le fonctionnement de la cellule, les relations intercellulaires, la résistance aux antibiotiques, les maladies héréditaires, les virus, … Une approche à partir de la confrontation des mécanismes normaux et pathologiques (recherches biomédicales). Une approche historique de certaines découvertes.

A. Read, D. Donnai. Génétique médicale – De la biologie à la pratique clinique. ed. De Boeck Supérieur  ,2008.

Ouvrage pour la mise à jour des connaissances, pour trouver des exemples supports d’activités, …
Un panorama en plusieurs chapitres pour aborder la génétique médicale, le conseil génétique aux maladies plurifactorielles, la médecine prénatale et la cancérologie. Chaque chapitre fait le lien entre les avancées de la biologie fondamentale, celles des techniques de laboratoire et de leurs conséquences en pratique clinique.

 P. Luchetta, M.C. Maurel, D. Higuet et al. Évolution moléculaire. Collection Sciences Sup – ed. Dunod, 2005.

Ouvrage pour la mise à jour des connaissances, pour trouver des exemples supports d’activités, …
Ouvrage qui rassemble les connaissances actuelles dans ce domaine, et notamment les mécanismes  moléculaires à l’origine de la création de nouveautés génétiques (duplication, insertion d’éléments transposables, brassage d’exons, épissage alternatif, rôle des pseudogènes et des introns dans l’évolution, …). Une partie entière est également consacrée à l’étude de la structure et à l’évolution des génomes ainsi qu’à la reconstitution et à la compréhension de l’histoire évolutive des êtres vivants.

J. Schacherer. La duplication des gènes, moteur de l'évolution. La Recherche, avril 2009, n°429

En 2004 l'équipe de Sanjeev Krishna, de l'école de médecine de l'hôpital St George de Londres, a ainsi étudié le génome d'une population de Plasmodium falciparum, le parasite responsable du paludisme. Cette population avait pour particularité d'être résistante à un médicament nommé méfloquinine. L'équipe londonienne a montré que cette résistance était corrélée à l'augmentation du nombre de copies d'un gène nommé pfmdr1. Il s'agit d'un gène qui code un transporteur impliqué dans l'expulsion, par le parasite, de nombreuses molécules toxiques (dont la méfloquinine). En avoir plusieurs copies constitue donc un avantage pour la population de Plasmodium concernée.

H. Tostivint .Familles multigénique et dynamique des génomes. bulletin APBG, 2010, n°3

Illustration de l’importance des duplications dans l’évolution de quelques familles multigéniques de vertébrés

Pierre-Henri Gouyon. Génétique et Évolution. Ed. Gallimard, coll. « CIRCO », 2007. 1 DVD.

Ressources - Sitographie





  • 1A2 - Diversification génétique et diversification des êtres vivants


Préambule

Remarque : les mécanismes de diversification abordés sont étroitement liés aux notions d’espèce et de spéciation, abordées dans le thème 1-A-3. Il est donc tout à fait possible d’aborder cette partie de programme après l’étude du thème 1-A-3, ou encore de profiter de l’étude menée à l’occasion de la découverte de la diversité des mécanismes de diversification des êtres vivants pour aborder la notion d’espèce et la notion de spéciation.

Il est préférable de ne pas se limiter à l’étude d’un exemple qui permettrait de tout aborder, mais de permettre aux élèves d’appréhender la diversité des mécanismes et des phénomènes impliqués, l’objectif prioritaire étant de développer chez les élèves des compétences en matière de pratique du raisonnement scientifique et de l’argumentation.
Acquis à mobiliser

• Notion de biodiversité à différentes échelles, et relations de cause à effet entre la biodiversité à l’échelle des organismes et la biodiversité génétique.
Le phénotype macroscopique dépend du phénotype cellulaire, lui-même induit par le phénotype moléculaire.
Le phénotype moléculaire dépend du patrimoine génétique de la cellule et de la nature des gènes qui s’expriment sous l’effet de l’influence de facteurs internes et externes variés.
L’expression d’un phénotype dépend donc du génotype et de l’environnement).
Les mutations sont la source aléatoire de la diversité des allèles, fondement de la biodiversité.
• Notion de caractères héréditaires, transmis lors de la reproduction sexuée, et modalités de cette transmission (cf thème 1-A-1 de terminale S).
• Possibilité de survenues d’anomalies lors du déroulement de la méiose, et perception des conséquences de ces anomalies, pour l’individu, mais aussi dans un contexte d’évolution du vivant.
• Notion de plan d’organisation (des vertébrés).
• Notion d’homologie moléculaire (utilisées pour établir des relations de parentés).

Représentations initiales et nouvelles notions à bâtir.

D’une façon générale, à ce stade des connaissances, les élèves pensent que ce sont les mutations qui sont essentiellement à l’origine de la diversification des formes de vie, donc des génomes. Ils ont découvert lors de l’étude du thème 1-A-1 que de nouveaux gènes pouvaient apparaître par duplication puis modification (mutations) d’un gène préexistant.
Il s’agit maintenant de leur faire prendre conscience :
• De la diversité des mécanismes de diversification des génomes.
• De l’existence et de l’importance des gènes impliqués dans le développement et des conséquences possibles de leurs variations.
• De la possibilité de diversification du vivant sans modifications génomes par mutations.
• De la possibilité de transmission de caractères comportementaux d’une génération à l’autre par voie non génétique.

Il est important de ne pas perdre de vue que les mécanismes étudiés ne le sont pas pour eux-mêmes, mais sont à étudier en relation avec leurs conséquences sur la diversification des êtres vivants.

Il ne s’agit pas ici d’aboutir à une liste de processus de diversification du vivant ni de viser l’exhaustivité, mais simplement de proposer aux élèves des situations de travail qui leur permettent d’appréhender la diversité et la complexité des mécanismes. L’accent sera mis sur la pratique de la démarche d’investigation, sur l’argumentation scientifique, sur le développement de l’autonomie des élèves, dans une optique de formation scientifique et de compréhension de ce qu’est la science, en perpétuelle évolution en fonction des nouvelles données disponibles.

Quelques pistes pédagogiques

Les pistes données ci-dessous s’adressent aux enseignants qui ont choisi d’aborder séparément les thèmes 1-A-2 et 1-A-3. Pour ceux qui ont choisi d’aborder de façon liée les thèmes 1-A-2 et 1-A-3, des pistes pédagogiques sont proposées dans le chapitre suivant.

Aborder les mécanismes de diversification des génomes / diversification des êtres vivants.

Si l’on souhaite aborder de manière distincte les mécanismes de diversification des génomes, un travail par ateliers,  tournants ou non, semble être la stratégie pédagogique la plus adaptée. Dans chaque atelier, les élèves disposent de documents, de données et d’outils de traitement de ces données, qui leur permettent d’identifier le mécanisme mis en jeu et d’en préciser les caractéristiques. Une communication synthétique à l’ensemble de la classe en fin de séance si les élèves n’ont travaillé chacun que sur un exemple, ou encore la réalisation d’une affiche ou d’un document donnant une idée de la diversité des mécanismes en jeu, seront l’occasion de développer des compétences dans le domaine de la communication scientifique.

Dans le cadre de la préparation des élèves aux études supérieures, il peut être intéressant ici de confronter les élèves à des documents scientifiques parfois un peu complexes, le travail consistant alors à en dégager les principes essentiels.

Quelques exemples :

(Certains sont utilisables dans le cadre d’une étude regroupée des notions des thèmes 1-A-2 et 1-A-3, car ils sont aussi l’occasion d’aborder les mécanismes à l’origine de la spéciation ou encore d’évoquer le cas d’hybrides fertiles)

Nombreux exemples de polyploïdisation chez les végétaux
Salamandres hybrides – polyploïdisation – hybrides fertiles ( site de l’académie de Nantes :
Souris de Madère – remaniements chromosomiques
Tournesols américains – polyploïdisation
Chou/navet (Raphanus) – polyploïdisation
Mollusques gastéropodes (Bulinus truncatus)–polyploïdisation (on connait des populations à 2n sous les tropiques, à 4n en milieu tempéré, à 6n et même 8n en altitude)

Aborder l’importance des changements dans l’expression des gènes de développement/diversification des êtres vivants :

Les élèves découvrent à cette occasion l’existence de gènes impliqués dans le développement.

Ils doivent arriver à percevoir le fait que ces gènes vont entrer en jeu à des moments et en des lieux précis lors du développement. La chronologie et le timing de l’expression de ces gènes sont donc essentiels, ce qui interroge sur leur « contrôle ». Aucune étude détaillée des modalités de l’expression de ces gènes et de leur contrôle n’est attendue.

Il est également important que les élèves découvrent l’homologie importante des gènes de développement au sein des groupes (vertébrés, mais aussi d’une façon plus générale au sein du vivant), dans l’optique de prendre conscience du fait que des changements dans ces gènes peuvent avoir des conséquences très importantes et être à l’origine de nouveaux plans d’organisation.

L’étude de mutants, par exemple chez les membracidés ou chez la drosophile, peut être l’occasion de découvrir les gènes de développement et les conséquences des changements dans leur expression. Les élèves doivent percevoir le fait que des organismes viables et fertiles, peuvent résulter de modifications de l’expression de gènes de développement et être à l’origine de nouvelles formes du vivant ( c’est l’idée de « monstre prometteur »).

• Une activité portant sur des comparaisons de séquences de gènes de développement homologues chez différents organismes sera l’occasion de découvrir les similitudes et de replacer ces constats dans une optique évolutive : on aura ici besoin de manipuler la notion d’homologie moléculaire, établie en classe de première à l’occasion de l’étude des parentés entre les primates à partir des pigments visuels.
• La mise en relation des conclusions obtenues à partir de l’étude des mutants pour les gènes de développement et de l’étude mettant en évidence les homologies des gènes de développement sera l’occasion d’amener les élèves à formuler des hypothèses concernant l’apparition de nouveaux plans d’organisation chez les êtres vivants.

Remarque
: une approche à partir de documents (textes et/ou illustrations) présentant des « monstres » peut s’avérer motivante pour les élèves, et peut également constituer un lien avec l’histoire des arts. A cette occasion, on peut mobiliser leurs représentations initiales sur les mécanismes pouvant expliquer l’apparition de ces monstres en termes scientifiques (mécanismes génétiques qui pourraient être impliqués), et les amener ensuite à découvrir l’existence de « monstres » vivants actuellement pour aborder les notions au programme et découvrir l’importance des gènes de développement et les conséquences des modifications de leur expression, notamment en terme évolutif).

Quelques exemples
 :
Aborder la diversification du vivant qui n’a pas pour cause initiale une modification du génome.

Il s’agit ici d’aborder un domaine qui est relativement nouveau pour les élèves (et peut être aussi pour les enseignants) : la transmission de génération en génération de caractères qui ne résultent pas, du moins à l’origine, de l’expression du génome.

Deux domaines sont envisagés ici : le cas des associations (symbioses notamment) et le cas de certains comportements (notamment chez les vertébrés).

Il est possible de mettre les élèves en activité autour d’études de cas. Des données variées sont fournies de façon à permettre aux élèves d’argumenter sur le fait que certains caractères soient réellement transmis de génération en génération, bien que leur apparition ne semble pas résulter pas d’un mécanisme de diversification du génome.
  • A propos des symbioses : il s’agit d’aborder essentiellement des exemples d’endosymbioses, dans l’optique d’étudier l’origine probable et la transmission de cette association de génération en génération. D’autre part, on pourra être amené à évoquer les transferts horizontaux de gènes à partir d’exemples simples ; on rapprochera alors cette étude de celle des mécanismes de diversification des génomes abordée précédemment.

  • A propos de la transmission de comportements nouveaux : il sera utile de préciser ce qu’est un comportement, les interactions qu’il comporte, et son importance dans des phases clés de la vie des êtres vivants (recherche de nourriture, rapprochement des partenaires pour la reproduction).
On peut être amené à évoquer ici la notion « d’empreinte », processus d’apprentissage mis en jeu pendant le développement des jeunes et qui produit une modification durable d’un comportement.

Cette empreinte pourrait être héritable, bien qu’elle ne soit pas génétique. Si cette notion est abordée, elle doit l’être dans un contexte où la sélection naturelle est abordée, car cette héritabilité ne se fera que si l’empreinte affecte la valeur sélective.

Certains exemples (concernant notamment la diversification de populations d’oiseaux (pouillot véloce / pouillot ibérique) en fonction du chant) sont des supports intéressants pour travailler la démarche expérimentale, démarche suivie par les chercheurs dans ce domaine (on parle de « démarche éthologique »). En effet, les chercheurs enregistrent les différents chants ou cris, les comparent pour repérer des séquences qui diffèrent selon les populations, font des hypothèses sur l’implication de ces modifications dans la « séparation des populations », puis testent leurs hypothèses en créant des séquences modifiées et en observant leur effet sur les populations naturelles.

Quelques exemples :

- Pour l’endosymbiose :
- La salamandre « chlorophyllienne » - exemple d’endosymbiose.
- Le ver géant Riftia et des bactéries autotrophiques – exemple d’endosymbiose.
- Les mycorhizes.
- Les planaires (Convoluta roscoffensis) qui hébergent des chrlorelles dans leur mésoderme).
- L’origine symbiotique des chloroplastes et des mitochondries.

- Pour les transferts horizontaux de gènes :
- Les ascidies dont la paroi contient de la cellulose.
- L’origine symbiotique des chloroplastes et des mitochondries.

- Pour la transmission de comportement à l’origine de la diversification des populations :
- Chants d’oiseaux, notamment chez les oiseaux-chanteurs ou oiseaux oscines (des études ont été réalisées chez la Paruline à sourcils blancs ou encore chez le Diamant mandarin).
- Pouillot véloce et pouillot ibérique.
- Utilisation d’outils chez certains primates (notion de « culture » chez les chimpanzés par exemple).


Quelques ressources pour enseigner le thème 1-A-2
  • Bibliographie
    P. Luchetta, M.C. Maurel, D. Higuet et al. Évolution moléculaire. Collection Sciences Sup – ed. Dunod, 2005
    Ouvrage pour la mise à jour des connaissances, pour trouver des exemples supports d’activités, …
    Ouvrage qui rassemble les connaissances actuelles dans ce domaine, et notamment les mécanismes moléculaires à l’origine de la création de nouveautés génétiques (duplication, insertion d’éléments transposables, brassage d’exons, épissage alternatif, rôle des pseudogènes et des introns dans l’évolution, …). Une partie entière est également consacrée à l’étude de la structure et à l’évolution des génomes ainsi qu’à la reconstitution et à la compréhension de l’histoire évolutive des êtres vivants.
    G. Lecointre. Guide critique de l’évolution. Ed. Belin, 2009.

    Dans cet ouvrage très riche, on trouvera en relation avec les mécanismes de diversification du génome une présentation du cas des tournesols américains, ainsi que des souris de Madère.

    D. Lestel. Les origines animales de la culture. Ed.Champs Flammarion, 2003.
    F. de Waal. De la réconciliation chez les Primates. Ed.Champs Flammarion, 2002.
    Danchin, Giraldeau, Cezilly. Ecologie comportementale. Ed. Armand Colin, 2005.
    P.H. Gouyon. Les avatars du gène. Ed. Belin, 1997.
    Article « la culture des chimpanzés ». Pour la Science - Octobre 2007 n° 57.
    Dossier « endosymbioses ». BIOFUTUR – n° 299 , MAI 2009.

    Logithèque

    Logiciel ANAGENE – comparaison de séquences nucléotidiques ou protéiques de gènes homéotiques ou des produits de leur expression
    Logiciel PHYLOGENE – arbres de parenté entre des gènes homéotiques

  • Sitographie

    A propos de la polyploïdisation

    • Diaporama « polyploïdisation et évolution des génomes » - ENS/univ Evry

    • Diaporama « les origines de l’amélioration des plantes » - Univ Montpellier 2 ; quelques diapos sur la polyploïdisation, les étapes historiques, l’intérêt,

    A propos de l’endosymbiose

    • Communiqué de presse CNRS : « échange de gènes entre une micro-algue et un virus géant » - Août 2009
    www2.cnrs.fr/presse/communique/1648.htm

    • Dossier de la station biologique de Roscoff – « relations de couple au soleil : l’endosymbiose cnidaires/Dinoflagellés »

    A propos des gènes de développement

    Site SNV Jussieu – Gènes homéotiques

    Site université de tous les savoirs – conférence vidéo sur le thème « les gènes homéotiques et l’évolution des animaux »

    Site de l’Université Pierre et Marie Curie - « développement embryonnaire et gènes sélecteurs »

    Site de l’INRP Acces (IFE/ENS)






  • Thème 1A3 - De la diversification des êtres vivants à l'évolution de la biodiversité.


  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 1A3 - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 1A3 - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 1A3 - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive


Préambule

Acquis à mobiliser

Les notions suivantes ont déjà été abordées :

• Biodiversité à divers échelles : la biodiversité est notamment décrite comme une diversité d’espèces, et la notion de biodiversité intraspécifique a été abordée et renforcée par l’étude du thème 1-A-2
• Biodiversité à un instant « t » = produit et étape de l’évolution
• Mécanismes de l’évolution : mécanismes d’évolution du génome – phénomènes permettant le maintien des nouveautés évolutives : sélection naturelle et dérive génétique
• Notion d’espèce
• Renouvellement des espèces au cours du temps
• Origine commune de tous les êtres vivants
• Relations de parenté entre les êtres vivants (phylogénies)
• modifications des milieux de vie au cours du temps (en relation notamment avec la tectonique globale, l’évolution des climats, l’influence de l’homme)

Représentations initiales et nouvelles notions à bâtir

L’élève a, à ce stade, une représentation de l’espèce qui est la suivante :

• Un ensemble d’individus qui présentent des caractéristiques communes (phénotypiques et caryotypiques)
• Un ensemble d’individus qui sont interféconds, et dont les descendants sont féconds également
• Il a également l’idée que les espèces se renouvellent au cours des temps géologiques, ce qui signifie qu’une espèce a une durée de vie limitée, qu’elle peut disparaître, et qu’elle est apparue à un moment donné. L’apparition de nouvelles espèces se fait toujours à partir d’espèces préexistantes. La notion d’espèce a donc été placée dans un contexte dynamique évolutif.

Il s’agit, en classe de terminale, d’amener les élèves à découvrir que le concept d’espèce n’est pas si tranché que cela, et donc de l’amener à remettre en cause ce qui était pour lui une certitude bien établie.

L’enjeu est ici essentiellement de faire comprendre aux élèves que l’on peut faire évoluer ses représentations à la lumière de données nouvelles. Ainsi, la notion d’espèces va évoluer pour devenir « une population d’individus isolés génétiquement des autres populations » (ce qui ne manquera de poser question si on y repense aux exemples de diversification du vivant à partir de mécanismes non génétiques …).

Les études menées seront aussi l’occasion de découvrir quelques modalités de spéciation, celle-ci étant envisagée dans un contexte dynamique, et en considérant l’espèce comme une réalité statistique et collective. Une nouvelle espèce apparaîtra donc lorsque l’on aura un nouvel ensemble qui s’individualise, autrement dit une population qui s’individualise.

On peut citer à ce propos G. Lecointre, professeur au Museum National d’Histoire Naturelle :
« Dans la nature il n’y a pas d’espèces : il n’apparait que des barrières de reproduction. Les espèces, c’est nous qui les créons à partir d’un modèle théorique » (Revue Espèces – n° 1 – septembre 2011).
Remarque : il pourra aussi être intéressant de se placer dans un contexte d’histoire des sciences autour de la définition et de l’évolution du concept d’espèce. Une approche épistémiologique permet de prendre conscience du fait qu’il y a effectivement plusieurs définitions possibles de l’espèce, en fonction du contexte dans lequel on se place.

Quelques pistes pédagogiques

Un contexte de démarche scientifique rigoureuse permet d’amener les élèves à faire évoluer leurs représentations initiales. On pourra donc proposer aux élèves des situations de travail où ils auront à mobiliser à la fois leurs connaissances et leurs savoir-faire en termes d’analyse de documents et de raisonnement scientifique.
Il sera intéressant de mettre les élèves en activité autour d’études de cas, en organisant le travail en ateliers, tournants ou non.

Les exemples choisis comme support de travail permettront aux élèves :

• De constater une évolution des populations au cours du temps (diversité phénotypique, en relation avec la diversification des génomes)
• D’appréhender les facteurs à l’origine de cette évolution (pression du milieu, concurrence entre les êtres vivants, hasard)
• De discuter des limites de la notion d’espèce (hybrides fertiles)

Quelques exemples

Le tableau ci-dessous donne quelques idées sur des exemples qui pourraient constituer des supports d’étude intéressants avec les élèves : (cf ressources)

Exemples
Mécanismes mis en jeu

Moustiques du métro de Londres
Mutations - spéciation par isolement géographique - sélection naturelle
Souris de Madère
Remaniements chromosomiques (fusions) – spéciation par isolement reproductif et/ou géographique – dérive génétique
Ours blanc/ours brun
(hybride : « le pizzly »)



Hybrides fertiles
Tigre et lion
Corneille noire / corneille mantelée
Pouillots asiatiques
Pieris napi / Pieris bryoniae
Tournesols américains
Modifications caryotypiques – spéciation par isolement reproductif – hybrides fertiles
Certains insectes Diptères (Culex, Aedes, Drosophila) dont les gamètes sont parasités par des Rickettsies ou par des bactéries du genre Wolbachia
Spéciation par isolement reproductif (les gamètes infectés par les rickettsies ne sont pas « compatibles » avec les gamètes non infectés)
Saumons (Onchorhynchus)
Isolement reproductif écologique
Crapauds du genre Bombina
Isolement reproductif écologique
Drosophiles
Selon les populations : isolement reproductif comportemental, isolement reproductif écologique, isolement reproductif mécanique
Mouche de la pomme (Rhagoletis)
Sélection diversifiante
Pouillot verdâtre (Phylloscopus trochiloïdes)
Anneaux de spéciation (spéciation par isolement géographique)
Attention l’interprétation a évolué depuis les premières études publiées, et notamment par rapport à ce qui était enseigné dans d’anciens programmes de la classe terminale)
Goélands de l’hémisphère nord (genre Larus)
Géosptizes des Galapagos

Spéciation – dérive génétique – sélection naturelle
Drépanicidés
Cyclidés des grands lacs africains
Fauvettes à tête noire
Spéciation – action de l’homme – compétition intraspécifique
Mésanges
Notion d’espèces, définition, limites
Guppy
Sélection naturelle / sélection sexuelle
Tigre/lion
Spéciation prézygotique - Barrière de reproduction = géographie et comportement
Mouton/chèvre
(développement de l’embryon stoppé au 1/3) Spéciation post-zygotique

 Quelques ressources pour enseigner le thème 1-A-3

Bibliographie

G. Lecointre. Guide critique de l’évolution. Ed. Belin,2009.
Les dossiers thématiques de cet ouvrage peuvent s’avérer particulièrement utiles (variation, sélection naturelle, adaptation, spéciation).
Des mises au point scientifiques et des études de cas
P. Lherminier. Le mythe de l’espèce. Ed. Ellipses, 2009.
Une réflexion « entre sciences et philosophie » sur le concept d’espèce.
L. Allano et A. Claemens. L’évolution, des faits aux mécanismes. Ed. Ellipses,2000.
De nombreux exemples sur la spéciation, documents à l’appui, dans le chapitre 1 « individus, populations, espèces ».
M. Ridley. Évolution biologique. Ed De Boeck, 2012.
Un grand classique, très pointu scientifiquement, et richement documenté.
T. Goldschmidt. Le vivier de Darwin, un drame sous le lac Victoria. Ed. Seuil – Collection Science Ouverte, 2003.
Un reportage scientifique sur un séjour de recherche au lac Victoria. Dans cet ouvrage on tente de comprendre comment la vie évolue et dans quelle mesure l’intervention de l’Homme peut rompre l’équilibre d’un écosystème.
M. Pascal, O. Lorvelec, JD Vigne. Invasions biologiques et extinctions. Ed. Belin – 2006
De très nombreux exemples sur l’évolution de certaines espèces de vertébrés en France.
S.J. Gould. La vie est belle : les surprises de l’évolution. Ed. Points Science, 2004.
Article : « le dialogue des Vervets ». Espèces, n° 2, décembre 2011.
Une étude réalisée chez des vervets (« singes verts ») sur la capacité de ces primates sociaux à localiser leurs congénères à partir de vocalisations échangées.
G. Lecointre. Article : « les espèces, c’est nous qui les faisons ». Espèces, n° 1, septembre 2011
Une mise au point particulièrement intéressante sur la notion d’espèces

Sitographie

A propos du concept d’espèce et de la spéciation :

Un article d’Hervé le Guyader « Doit-on abandonner le concept d’espèce ? » sur le site de l’INRA www.inra.fr/dpenv/leguyc46.htm
Tous les points importants du concept sont repris, expliqués, discutés et mis en perspective dans l’approche nouvelle du vivant et de son histoire

Un article de Pascal Tassy sur le site du Museum National d’Histoire Naturelle à propos de la définitions de l’espèce en paléontologie : « L’émergence du concept d’espèce fossile : le mastodonte américain (Proboscidea, Mammalia) entre clarté et confusion »
www.mnhn.fr/publication/geodiv/g02n2a1.html

Dossier « les mécanismes de l’évolution » - G. Lecointre et A. Dettaï – site SNV Jussieu
www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/evolution/evol/mecaevol.htm

Un dossier sur le site de l’université de Berkley sur l’évolution, avec une partie sur la spéciation – des animations humoristiques très intéressantes
http://evolution.berkeley.edu/evolibrary/article/evo_01

Un exemple d’activité sur la spéciation en anneau des Salamandres californiennes, avec utilisation de Google Map
http://svt.ac-rouen.fr/biologie/speciation_salamandre/spesalam.html

Un diaporama qui aborde le thème de la sélection sexuelle sur le site de l’université Lille 1 :  auteur : M. Amsellem
http://gepv.univ-lille1.fr/downloads/enseignements/L2-S3/L2-S3-EcolGen_Selec_sexuelle.pdf

A propos de biodiversité et d’évolution :

Dossiers SagaSciences du CNRS : biodiversité
www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosbiodiv/index.html

Dossier SagaSciences du CNRS : évolution
www.cnrs.fr/cw/dossiers/dosevol/accueil.html

Sur le site Planet Terre de l’ENS : « Sélection naturelle, VIH, Pinsons : ce que Darwin ne pouvait pas savoir » - O. Chassaing, F. Campo Paysaa : http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-selection-VIH-pinsons-darwin.xml#id2713234

Logithèque

Modélisation de l’évolution des pinsons des Galapagos avec le logiciel Vensim PLE :
www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/spip.php?article453

Simulation graphique de la dérive génétique et de la sélection naturelle à partir de l’exemple de la phalène du bouleau – programme « Java » permettant de simuler l’évolution des allèles au sein d’une population, en fonction des génotypes choisis et de l’avantage apporté ou non.

Utilisation de Google Earth et de fichiers kmz pour aborder la biodiversité des moustiques. Les informations contenues dans ce dossier permettent d’étudier l’évolution de l’espèce Culex pipens au cours du temps.
http://svt.ac-montpellier.fr/spip/spip.php?article89


  • Thème 1A4 - Un regard sur l'évolution de l'homme


Acquis à mobiliser

• Place de l’Homme au sein des Vertébrés et des Primates. (arbre de parenté dans lequel l’Homme est placé).
• Principe d’établissement des arbres de parenté à partir de caractères phénotypiques et de caractères moléculaires.
• Notion de gènes de développement, et importance des modalités de leur expression. (chronologie, lieu).
• Phénotype : résultat de l’expression des gènes et de l’influence de certains facteurs de l’environnement.
• Transmission possible de génération en génération de certains caractères comportementaux ou culturels.

Représentations initiales et nouvelles notions à bâtir

Les élèves ont beaucoup d’idées préconçues sur la place de l’Homme au sein des Primates, et les médias se font régulièrement l’écho de nouvelles découvertes paléontologiques où l’on aurait enfin trouvé « l’ancêtre de l’Homme » ou celui des Primates. Bien qu’ils aient abordé en classe de 3e la place de l’Homme au sein du monde vivant, et notamment au sein des Primates, des représentations erronées persistent souvent. Il est nécessaire, lorsque l’on aborde cette étude, de mobiliser d’une façon ou d’une autre les représentations des élèves, ne serait-ce parfois que pour faire un premier « tri » et préciser que le travail portera uniquement sur l’aspect scientifique des choses.

Une des manières d’aborder les nouvelles notions à bâtir peut être de les regrouper en deux domaines complémentaires : ce qui relève de la dynamique évolutive au sein du groupe des Primates, et ce qui relève des mécanismes et des phénomènes à l’origine de la diversification Homme / Chimpanzé. Le point suivant développe cette approche, qui n’est pas la seule possible bien évidemment.

Quelques pistes pédagogiques

Il s’agit bien ici, comme l’indique le titre du thème 1-A-4, de porter « un regard sur l’évolution de l’Homme ». Il y a une grande diversité de regards possibles, et l’objectif essentiel qui est poursuivi est d’amener les élèves à développer ici le « regard scientifique », à l’identifier clairement et à appréhender le fait que dans ce domaine de l’étude de l’évolution de l’Homme, comme dans d’autres domaines, la « science est en mouvement », que des controverses subsistent (notamment autour de l’arbre phylogénétique du genre Homo), et que chaque nouvelle découverte peut remettre les choses en cause, à condition que l’analyse qui en est faite soit pertinente scientifiquement.

L’une des approches possible est de porter deux « regards scientifiques » sur l’évolution de l’Homme :

Un « regard scientifique sur la place de l’Homme dans la dynamique évolutive des Primates » :

Origine des Primates.
Arbre phylogénétique traduisant les parentés Homme/chimpanzé (avec la notion de dernier ancêtre commun : DAC), ainsi que les parentés au sein du genre Homo, en relation avec les caractéristiques de ce groupe et la diversification des caractères au sein de ce groupe.
Dynamique de l’évolution au sein du groupe des grands Primates et au sein du groupe Homo : apparition, diversification (caractère buissonnant), puis réduction de la diversité.

Un « regard scientifique sur les mécanismes qui ont pu être à l’origine de la diversification Homme/chimpanzé à partir de leur dernier ancêtre commun » :

Acquisition du phénotype humain au cours du développement pré et post natal : interactions entre l’expression de l’information génétique et l’environnement (y compris les relations sociales).
Différences génétiques Homme/Chimpanzé en lien avec des différences de position et de chronologie de certains gènes.

Un des objectifs principaux de ce thème 1-A-4 à travers ce travail sur les arbres phylogénétiques est de développer la réflexion scientifique des élèves, de les mettre en situation de raisonner à partir des connaissances et des savoir-faire qu’ils maîtrisent à ce stade, de s’interroger et d’appréhender le fait que les résultats obtenus peuvent varier en fonction des caractères pris en compte ou des fossiles considérés, des incertitudes et des controverses demeurant à ce jour et faisant débat parmi les scientifiques.

Plusieurs stratégies pédagogiques sont envisageables, et il conviendra de varier la nature des activités proposées. Ainsi, outre les activités classiques, il pourrait être intéressant dans ce domaine où persistent beaucoup d’idées préconçues, d’afficher certaines de ces idées, et d’amener les élèves à les confronter aux données scientifiques afin d’argumenter sur leur validité ou non.

Aborder la dynamique évolutive des Primates.

- Il s’agit d’appliquer au genre Homo les acquis en matière d’établissement de relations de parenté, puis de faire prendre conscience à l’élève du caractère buissonnant d’un arbre phylogénétique à partir de l’exemple de ce groupe.

Ainsi, on amènera par exemple l’élève à faire évoluer l’arbre très simple construit dans un premier temps pour placer l’Homme au sein des Primates vers un arbre beaucoup plus buissonnant, en greffant sur la « branche » spécifique à l’Homme quelques espèces fossiles du genre Homo, tout cela étant justifié par un raisonnement scientifiquement rigoureux.

Il est important de permettre aux élèves de travailler sur des arbres de parenté avec différentes approches, construction, manipulation, lecture et analyse, de façon à s’assurer qu’ils maîtrisent bien sa signification.

Une activité où l’on a recours à l’utilisation d’un logiciel de traitement de données (exemple : Phylogène) présente l’intérêt particulier de permettre aux élèves de manipuler facilement les arbres, ainsi que pour évoquer la notion de DAC. Il est alors fort intéressant pour la formation scientifique des élèves de leur  laisser la possibilité, après une prise en main du logiciel et de ses fonctionnalités, de travailler la démarche d’investigation et de développer leur autonomie.

Il serait également intéressant en terme de formation des élèves de les placer en situation de résolution d’une tâche complexe dans laquelle ils disposent de documents leur permettant d’observer divers caractères d’individus du genre Homo et de Chimpanzés, ainsi que de documents présentant un ou    plusieurs arbres de parenté différents où les individus présentés sont placés. L’activité peut alors consister, par exemple, à utiliser les informations apportées par ces documents pour argumenter sur la validité de tel ou tel arbre.

- Une fois découvert le caractère « buissonnant » qu’a pris l’arbre phylogénétique lorsque l’on y a placé les fossiles du genre Homo, un regard plus global peut être porté sur la diversité au sein du groupe des Grand Primates, et surtout sur son évolution au cours du temps. Une comparaison pourra être faite avec d’autres groupes de Primates, comme celui des Cercopithécoïdes, qui eux connaissent une grande diversification actuelle.

Les élèves ne manqueront pas de vouloir poursuivre le débat sur les raisons de l’affaiblissement de la diversité au sein du groupe des grands Primates. Les réponses ne peuvent pas être apportées ici, mais la réflexion pourrait par exemple se prolonger dans le cadre de l’accompagnement personnalisé, en relation avec l’enseignement de philosophie.

Aborder les mécanismes à l’origine de la diversification Homme/chimpanzé à partir de leur DAC

Une approche à partir de données biologiques est particulièrement motivante pour les élèves : séquences vidéos montrant le développement pré et post natal chez l’Homme et le Chimpanzé, photos et/ou textes décrivant quelques étapes de ce développement, …

On s’intéressera aussi bien aux aspects « physiques » du développement qu’aux aspects comportementaux et sociétaux. Quelques points communs et quelques différences entre ce qui se passe chez l’Homme et ce qui se passe chez le Chimpanzé seront dégagés, ce qui permettra :
 • de constater que dans les deux cas le phénotype s’acquiert au cours du développement pré et post natal, sous l’effet de l’interaction entre l’expression de l’information génétique et l’environnement (dont la relation aux autres individus). On pourra saisir l’occasion de proposer aux élèves des documents concernant les apprentissages et la transmission des cultures chez les chimpanzés et les humains.

• de s’interroger sur les mécanismes à l’origine des différences constatées. A ce propos, les acquis du thème 1-A-2 seront mobilisés (existence de gènes de développement et importance de changement dans leurs modalités d’expression). La néoténie pourra ainsi être abordée.

Remarques :
• Il n’est pas attendu ici de connaissances spécifiques sur les gènes de développement humains, sur la néoténie ou les hétérochronies. Les informations et notions nécessaires seront fournies aux élèves, l’objectif poursuivi étant essentiellement de développer le raisonnement scientifique.

• Une des possibilités offerte dans cette partie de programme est de s’appuyer sur une conférence scientifique (en présentiel ou sous forme de conférence vidéo-enregistrée). La confrontation des élèves à une telle source d’information peut être l’occasion de développer des compétences spécifiques (prise de note – réalisation d’une synthèse – identification des enjeux – travail sur le questionnement et l’argumentation …)
  • Quelques ressources pour enseigner le thème 1-A-4

    Bibliographie

    G. Lecointre. Guide critique de l’évolution. Ed. Belin, 2009.

    P. Picq. Les origines de l’Homme – l’odyssée de l’espèce. Ed . Seuil Points Sciences, 2005.

    Article : « l’animal / l’homme ». Espèces n° 2, décembre 2011.

    P. Picq. Article « la bipédie est-elle spécifique à l’Homme ? ». Pour la Science. Dossier n° 57, Octobre/décembre 2007.

    E. Grundmann. Article « l’apprentissage chez les chimpanzés ». La Recherche.
    www.larecherche.fr/content/recherche/article?id=8240
Logithèque

Logiciel Phylogène (INPR / IFE) et ses bases de données (phénotypiques et moléculaires) sur les Primates et sur le genre Homo.

Logiciel « Lignée humaine » - Pierre Perez – Cet outil permet d'appréhender plusieurs aspects des caractères évolutifs liés à la « lignée humaine » et à la place de l'Homme dans le règne animal.

Animation pour visualiser la caractère buissonnant de l’arbre pour le genre Homo.
www.biologieenflash.net/animation.php?ref=geo-0016-3


  • Thème 1A5 - Les relations entre organisation et mode de vie, résultat de l'évolution : l'exemple de la vie fixée chez les plantes

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 1A5 - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 1A5 - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 1A5 - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive


Thème 1B - Le domaine continental et sa dynamique


Préambule 
Le programme de terminale S poursuit l’étude, entamée en première S, de la dynamique du globe terrestre. Le programme aborde ici le domaine continental, qui est d’abord caractérisé (structure, composition chimique et âge) avant que ne soient étudiées les zones de convergence avec la formation des chaînes de montagne et la production de nouveaux matériaux continentaux. Le recyclage des matériaux de la croûte continental est lui construit à partir de l’étude de l’altération et de l’érosion des chaines de montagne, mécanismes conduisant à la formation des dépôts sédimentaires. Comme pour les autres parties du programme, il s’agit de faire découvrir aux élèves les grands éléments et principes de géologie en se basant sur les faits de terrain (dont les exemples locaux) ou les faits expérimentaux. Les connaissances et les compétences acquises ici, permettront aux élèves de les appliquer à d’autres thématiques de tronc commun et de spécialité.

Sens général du thème 1B (problématique) : Comprendre l’évolution de la lithosphère continentale à travers la compréhension de l’affleurement de la seule croûte continentale en zone émergé, son origine et son devenir.

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive


  • Thème 1B1 - La caractérisation du domaine continental : Lithosphère continentale, reliefs et épaisseur crustale.
  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 1B1 - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 1B1 - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 1B1 - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive

- Modélisation de la dynamique de la subduction profonde :

Modélisation analogique en laboratoire permettant de comprendre les différents modes de déformations des plaques subductées.
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-model-subductionprofonde.Xml
-Calculs de profondeurs du Moho :

Calcul de la profondeur du Moho, de points de réflexion et de vitesses des ondes P et S dans les Alpes par analyse sismique de données extraites du logiciel Sismolog et/ou par l’utilisation d’un fichier Tableur :
www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/spip.php?article176

- Isostasie :

Evolution de l’équilibre vertical de la lithosphère continentale grâce à deux modèles, l’un numérique (logiciel “Airy”, constituant le support d’activités et téléchargeable sur site) et l’autre analogique (à construire au laboratoire) :
www.ac-nantes.fr/peda/disc/svt/isostasie/index.htm

- Marqueurs de compression et d’empilement :

Notamment à travers les Alpes, sous forme de  microactivités géolocalisées : (GéolSIG - Après lecture de l’introduction, choisir dans le menu gauche la collection “Collision”)
www.labosvt.com/geolsig

- Radiochronologie :

… et les fiches techniques du logiciel “Radiochronologie” :
http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/dossiers/FT/radiochronologie

- Radiochronologie, datation du granite de St Sylvestre par la méthode des isochrones. Cette datation peut être obtenue via un logiciel tableur et/ou ou le logiciel Radiochronologie (téléchargement et fiche technique : voir Sitographie) :
www.ac-limoges.fr/svt/accueil/html/granites/divet370_223.htm

- Radiochronologie datation par la méthode Rb/Sr fournissant pour chacun le contexte géologique et les rapports isotopiques permettant de déterminer l’âge des échantillons : 


Bibliographie pour le thème 1B

Ouvrages généraux pour le thème 1B

-AMAUDRIC DU CHAFFAUT S. Tectonique des plaques, l’activité interne du globe terrestre et ses conséquences. 1999. Focus CRDP de l’Académie de Grenoble.188 p.
-CARON J.M. et al. Comprendre et enseigner la planète Terre. 2007. Ophrys éditions.303 p.
-DEBELMAS J. et al. Les grandes structures géologiques, 5ème édition. 2008. Dunod. 316 p.
-DERCOURT J. et al. Géologie, objets, méthodes et modèles, 12ème édition. 2006. Dunod. 532 p
-JOLIVET L. Géodynamique. 1998. Dunod. 226 p.
-MARSHAK S. Terre, portrait d’une planète. 2010. De Boeck Université. 833 p.
-MATTAUER M. Ce que disent les pierres. 1999. Bibliothèque Pour la Science.144 p.
-NICOLLET C. Métamorphisme et géodynamique. 2010. Dunod. 288 p.
-PEYCRU P. et al. Géologie, tout en un, 1ère et 2ème années BCPST. 2008. Dunod. 640 p.
-POMEROL et al. Éléments de géologie, 14ème édition. 2011. Dunod. 959 p.
-PROST A. La Terre, 50 expériences pour découvrir notre planète.1999. Belin. 124 p.

Ouvrages spécialisés pour le thème 1B

AVOUAC J. P., DE WEBER P. (ouvrage collectif). Hymalaya-Tibet, le choc des continents. 2002. Muséum national d’histoire naturelle, CNRS éditions.191 p.
BARDINTZEFF J.M. Volcanologie. 2011 Dunod. 313 p.
BONIN B., MOYEN J. F. Magmatisme et roches magmatiques, 3ème édition. 2011. Dunod. 313 p.
BRUNET F. et al. Roches et matériaux en conditions extrêmes. 2007. Vuibert. 202 p.
LALLEMAND et al. Convergence lithosphérique, société géologique de France. 2005. 182 p.
LALLEMAND S. La subduction océanique. 2007. Éditions scientifiques GB. 193 p.
MEHIER B. Magmatisme et tectonique des plaques. 1998. Ellipses. 256 p.
WESTPHAL M., WHITECHURCH H., MUNSCHY M. La tectonique des plaques. 2003. Collection Géosciences GB Science Publisher. 307 p.

Articles scientifiques pour le thème 1B

BALLEVRE M. Groix : une île fossile. Pour la science. 2003, mars, pp. 72-79.
GURNIS M. La sculpture des reliefs terrestres. Pour la science. 2001, mai, pp. 44-51.
HAZEN R. L’évolution des minéraux. Pour la science. 2010, juin, pp. 54-61.
LE MEUR H. Les Alpes battent en retraite. La recherche. 2003, juin, pp. 30-37.
LEMARCHAND F. La tectonique des plaques. La recherche. 2007, juin, pp. 50-55.
MATTAUER M. L’autonomie (géologique) de la Corse. Pour la science. 2001, août, pp. 76-78.
MATTAUER M. Coésite et formation des chaines de montagne. Pour la science. 2001, novembre, pp. 26- 29.
MATTAUER M. La tectonique des plaques. Pour la science. 2002, mai, pp. 70-75.
PHILIPPE MATTE La chaîne hercynienne reconstituée. Pour la science. 2003, septembre, pp. 58-63.
VANDERHAEGHE O. Les montagnes, des colosses au cœur tendre. Pour la science. 2009, janvier, pp. 34-40.

Sitographie pour le thème 1B

Sites généraux pour le thème 1B

- Planet terre : ressources en géologie, sciences de la Terre…
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre

Dont :
 • La diversité des ophiolites
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-diversite-desophiolites.
Xml

La fusion partielle et l’anatexie :
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/objets/img_sem/XML/db/planetterre/metadata/LOMImg324-
2010-09-13.xml

Principe de datation Rb-Sr, avec exemples :
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-datation-rubidiumstrontium.
Xml

Site riche en schémas, expériences, modélisations sur les phénomènes de divergence, convergence et subduction. Utilisable par les professeurs et les élèves.

Pétrographie pour le thème 1B

Logiciel de simulation, utilisation du microscope polarisant, suivi des roches lors de la subduction et fusion partielle de la péridotite. Utilisable par les élèves pour réviser leur cours.


Dont :
• Le Chenaillet : une excursion à travers une ophiolite de type LOT

• Série métamorphique du Haut-Alier et marqueurs de compression hercyniens :

- Le monde des ophiolites
http://ophiolite.free.fr

L’ophiolite d’Oman, son Log synthétique avec diaporama commenté, des photographies des différentes unités de l’ophiolite.

- Géologie et géochimie des massifs ophiolitiques de Saga et Sangsang de la zone de suture du Yarlung Zangbo, Tibet
http://archimede.bibl.ulaval.ca/archimede/fichiers/26079/26079.html

Sujet de thèse très complet, sur cette ophiolite, nombreuses illustrations…

Tectonique

- La formation des chaines de montagne
www2.ggl.ulaval.ca/personnel/bourque/intro.pt/planete_terre.html
Cours du département de géologie et de génie géologique de l’université Laval au Québec. Un cours d'introduction et de culture scientifique en Sciences de la Terre, accessible à tous, axé sur les grands et petits phénomènes qui affectent et régissent notre planète: dérive des continents, tectonique des plaques, …


- Sur la géologie Alpine

Nombreuses vidéos (formation des chaînes de montagne, formation de l’Himalaya, tectonique des plaques, expansion océanique, subduction…). Les commentaires sont en anglais.

- La subduction et l’obduction
www.geopedia.fr
Encyclopédie des sciences de la terre et du monde souterrain. Géologie, paléontologie, vulcanologie, archéologie, évolution des espèces, éclairage, taille de pierre, spéléologie, mines, carrières, catacombes et cartographie. De petits résumés pour différents cours de géologie. En particulier la subduction et l’obduction.

Isostasie et géodésie

- Des “fiches de cours” simples, illustrées et multilingues (Fr, En, De), principalement à destination des élèves (menu / item “Géodésie”) :
http://jabba.unil.ch/objectif-terre/index.php?id=3160

- Une petite histoire tectonique (très) résumée de la Terre (menu / item “Histoire de la planète”) :
www2.ggl.ulaval.ca/personnel/bourque/intro.pt/planete_terre.html

Des outils SIG

- Pages SIG du site SVT de Montpellier
http://svt.ac-montpellier.fr/spip/spip.php?rubrique5

Ce site présente les principes de bases de l’utilisation des globes virtuels type Google Earth et un certain nombre d’exemple d’utilisation en géologie.

- Application Google Earth pour les SVT
wwwpsvt.free.fr/svt/geol/google_earth/telecharger.htm
Il regroupe tout un ensemble de données recherchées sur différents sites. Il permet de télécharger des fichiers « layers », des dossiers « layers » (France,Alpes), des cartes géologiques et schémas structuraux, des documents dynamiques (tectonique), des dossiers d’intérêt géologique et pédagogique (volcanisme, tectonique, afars). Il permet de créer ses propres fichiers kmz.

- SIG géologique mondialisé
http://portal.onegeology.org ou http://onegeology.org/portal/home.html

Site permettant de créer de très nombreuses et variées cartes géologiques personnalisées (Âge des roches, etc) avec possibilité de les exporter en fichiers kmz (pour une exploitation secondaire sur GoogleEarth).




  • Thème 1B2 - La convergence lithosphérique : contextes de la formation des chaînes de montagnes
  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 1B2 - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 1B2 - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 1B2 - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive
- Sujet TP agrég interne :

Les ophiolites et la lithosphère océanique
http://maitres.snv.jussieu.fr/agreginterne
Différents postes (objectifs cognitifs et méthodologiques, supports didactiques, activités et productions élèves, notions construites).

- Sujets ECE 2011 :


- Tectoglob, la subduction :


- Le moteur de la subduction :

www-peda.ac-martinique.fr/svt/tpts_tp3.shtm
Le collègue soumet des documents qui permettent à l'élève de réviser et de comprendre un des moteurs de la subduction. Des exercices et des activités pratiques sont également proposés et favorisent un travail autonome de l'élève.


Bibliographie pour le thème 1B

Ouvrages généraux pour le thème 1B

-AMAUDRIC DU CHAFFAUT S. Tectonique des plaques, l’activité interne du globe terrestre et ses conséquences. 1999. Focus CRDP de l’Académie de Grenoble.188 p.
-CARON J.M. et al. Comprendre et enseigner la planète Terre. 2007. Ophrys éditions.303 p.
-DEBELMAS J. et al. Les grandes structures géologiques, 5ème édition. 2008. Dunod. 316 p.
-DERCOURT J. et al. Géologie, objets, méthodes et modèles, 12ème édition. 2006. Dunod. 532 p
-JOLIVET L. Géodynamique. 1998. Dunod. 226 p.
-MARSHAK S. Terre, portrait d’une planète. 2010. De Boeck Université. 833 p.
-MATTAUER M. Ce que disent les pierres. 1999. Bibliothèque Pour la Science.144 p.
-NICOLLET C. Métamorphisme et géodynamique. 2010. Dunod. 288 p.
-PEYCRU P. et al. Géologie, tout en un, 1ère et 2ème années BCPST. 2008. Dunod. 640 p.
-POMEROL et al. Éléments de géologie, 14ème édition. 2011. Dunod. 959 p.
-PROST A. La Terre, 50 expériences pour découvrir notre planète.1999. Belin. 124 p.

Ouvrages spécialisés pour le thème 1B

AVOUAC J. P., DE WEBER P. (ouvrage collectif). Hymalaya-Tibet, le choc des continents. 2002. Muséum national d’histoire naturelle, CNRS éditions.191 p.
BARDINTZEFF J.M. Volcanologie. 2011 Dunod. 313 p.
BONIN B., MOYEN J. F. Magmatisme et roches magmatiques, 3ème édition. 2011. Dunod. 313 p.
BRUNET F. et al. Roches et matériaux en conditions extrêmes. 2007. Vuibert. 202 p.
LALLEMAND et al. Convergence lithosphérique, société géologique de France. 2005. 182 p.
LALLEMAND S. La subduction océanique. 2007. Éditions scientifiques GB. 193 p.
MEHIER B. Magmatisme et tectonique des plaques. 1998. Ellipses. 256 p.
WESTPHAL M., WHITECHURCH H., MUNSCHY M. La tectonique des plaques. 2003. Collection Géosciences GB Science Publisher. 307 p.

Articles scientifiques pour le thème 1B

BALLEVRE M. Groix : une île fossile. Pour la science. 2003, mars, pp. 72-79.
GURNIS M. La sculpture des reliefs terrestres. Pour la science. 2001, mai, pp. 44-51.
HAZEN R. L’évolution des minéraux. Pour la science. 2010, juin, pp. 54-61.
LE MEUR H. Les Alpes battent en retraite. La recherche. 2003, juin, pp. 30-37.
LEMARCHAND F. La tectonique des plaques. La recherche. 2007, juin, pp. 50-55.
MATTAUER M. L’autonomie (géologique) de la Corse. Pour la science. 2001, août, pp. 76-78.
MATTAUER M. Coésite et formation des chaines de montagne. Pour la science. 2001, novembre, pp. 26- 29.
MATTAUER M. La tectonique des plaques. Pour la science. 2002, mai, pp. 70-75.
PHILIPPE MATTE La chaîne hercynienne reconstituée. Pour la science. 2003, septembre, pp. 58-63.
VANDERHAEGHE O. Les montagnes, des colosses au cœur tendre. Pour la science. 2009, janvier, pp. 34-40.

Sitographie pour le thème 1B

Sites généraux pour le thème 1B

- Planet terre : ressources en géologie, sciences de la Terre…
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre

Dont :
 • La diversité des ophiolites
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-diversite-desophiolites.
Xml

La fusion partielle et l’anatexie :
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/objets/img_sem/XML/db/planetterre/metadata/LOMImg324-
2010-09-13.xml

Principe de datation Rb-Sr, avec exemples :
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-datation-rubidiumstrontium.
Xml

Site riche en schémas, expériences, modélisations sur les phénomènes de divergence, convergence et subduction. Utilisable par les professeurs et les élèves.

Pétrographie pour le thème 1B

Logiciel de simulation, utilisation du microscope polarisant, suivi des roches lors de la subduction et fusion partielle de la péridotite. Utilisable par les élèves pour réviser leur cours.


Dont :
• Le Chenaillet : une excursion à travers une ophiolite de type LOT

• Série métamorphique du Haut-Alier et marqueurs de compression hercyniens :

- Le monde des ophiolites
http://ophiolite.free.fr

L’ophiolite d’Oman, son Log synthétique avec diaporama commenté, des photographies des différentes unités de l’ophiolite.

- Géologie et géochimie des massifs ophiolitiques de Saga et Sangsang de la zone de suture du Yarlung Zangbo, Tibet
http://archimede.bibl.ulaval.ca/archimede/fichiers/26079/26079.html

Sujet de thèse très complet, sur cette ophiolite, nombreuses illustrations…

Tectonique

- La formation des chaines de montagne
www2.ggl.ulaval.ca/personnel/bourque/intro.pt/planete_terre.html
Cours du département de géologie et de génie géologique de l’université Laval au Québec. Un cours d'introduction et de culture scientifique en Sciences de la Terre, accessible à tous, axé sur les grands et petits phénomènes qui affectent et régissent notre planète: dérive des continents, tectonique des plaques, …


- Sur la géologie Alpine

Nombreuses vidéos (formation des chaînes de montagne, formation de l’Himalaya, tectonique des plaques, expansion océanique, subduction…). Les commentaires sont en anglais.

- La subduction et l’obduction
www.geopedia.fr
Encyclopédie des sciences de la terre et du monde souterrain. Géologie, paléontologie, vulcanologie, archéologie, évolution des espèces, éclairage, taille de pierre, spéléologie, mines, carrières, catacombes et cartographie. De petits résumés pour différents cours de géologie. En particulier la subduction et l’obduction.

Isostasie et géodésie

- Des “fiches de cours” simples, illustrées et multilingues (Fr, En, De), principalement à destination des élèves (menu / item “Géodésie”) :
http://jabba.unil.ch/objectif-terre/index.php?id=3160

- Une petite histoire tectonique (très) résumée de la Terre (menu / item “Histoire de la planète”) :
www2.ggl.ulaval.ca/personnel/bourque/intro.pt/planete_terre.html

Des outils SIG

- Pages SIG du site SVT de Montpellier
http://svt.ac-montpellier.fr/spip/spip.php?rubrique5

Ce site présente les principes de bases de l’utilisation des globes virtuels type Google Earth et un certain nombre d’exemple d’utilisation en géologie.

- Application Google Earth pour les SVT
wwwpsvt.free.fr/svt/geol/google_earth/telecharger.htm
Il regroupe tout un ensemble de données recherchées sur différents sites. Il permet de télécharger des fichiers « layers », des dossiers « layers » (France,Alpes), des cartes géologiques et schémas structuraux, des documents dynamiques (tectonique), des dossiers d’intérêt géologique et pédagogique (volcanisme, tectonique, afars). Il permet de créer ses propres fichiers kmz.

- SIG géologique mondialisé
http://portal.onegeology.org ou http://onegeology.org/portal/home.html

Site permettant de créer de très nombreuses et variées cartes géologiques personnalisées (Âge des roches, etc) avec possibilité de les exporter en fichiers kmz (pour une exploitation secondaire sur GoogleEarth).


  • Thème 1B3 - Le magmatisme des zones de subduction : une production de nouveaux matériaux continentaux
  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 1B3 - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 1B3 - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 1B3 - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive
- Transformations minéralogiques :

Transformations minéralogiques dans les zones de subduction.
http://eduscol.education.fr/cid47782/liste-des-situations-evaluation.html

- Étude des minéraux :

Étude des minéraux rencontrés dans les zones de subduction à l’aide du logiciel MinUSc
www.ac-nice.fr/svt/productions/minusc/subduction-minusc/index.html
Utilisation du logiciel MinUSC pour montrer la relation entre la croûte océanique qui subducte et la fusion du manteau sus-jacent

- Observation macro et microscopique :

Observation macro et microscopique de roches produites par magmatisme de subduction.
www.labosvt.com/article140.html
Évaluation de la quantité d’eau présente dans une roche lithosphérique par l’utilisation de Mesurim et d’un tableur
www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/spip.php?article392


Bibliographie pour le thème 1B

Ouvrages généraux pour le thème 1B

-AMAUDRIC DU CHAFFAUT S. Tectonique des plaques, l’activité interne du globe terrestre et ses conséquences. 1999. Focus CRDP de l’Académie de Grenoble.188 p.
-CARON J.M. et al. Comprendre et enseigner la planète Terre. 2007. Ophrys éditions.303 p.
-DEBELMAS J. et al. Les grandes structures géologiques, 5ème édition. 2008. Dunod. 316 p.
-DERCOURT J. et al. Géologie, objets, méthodes et modèles, 12ème édition. 2006. Dunod. 532 p
-JOLIVET L. Géodynamique. 1998. Dunod. 226 p.
-MARSHAK S. Terre, portrait d’une planète. 2010. De Boeck Université. 833 p.
-MATTAUER M. Ce que disent les pierres. 1999. Bibliothèque Pour la Science.144 p.
-NICOLLET C. Métamorphisme et géodynamique. 2010. Dunod. 288 p.
-PEYCRU P. et al. Géologie, tout en un, 1ère et 2ème années BCPST. 2008. Dunod. 640 p.
-POMEROL et al. Éléments de géologie, 14ème édition. 2011. Dunod. 959 p.
-PROST A. La Terre, 50 expériences pour découvrir notre planète.1999. Belin. 124 p.

Ouvrages spécialisés pour le thème 1B

AVOUAC J. P., DE WEBER P. (ouvrage collectif). Hymalaya-Tibet, le choc des continents. 2002. Muséum national d’histoire naturelle, CNRS éditions.191 p.
BARDINTZEFF J.M. Volcanologie. 2011 Dunod. 313 p.
BONIN B., MOYEN J. F. Magmatisme et roches magmatiques, 3ème édition. 2011. Dunod. 313 p.
BRUNET F. et al. Roches et matériaux en conditions extrêmes. 2007. Vuibert. 202 p.
LALLEMAND et al. Convergence lithosphérique, société géologique de France. 2005. 182 p.
LALLEMAND S. La subduction océanique. 2007. Éditions scientifiques GB. 193 p.
MEHIER B. Magmatisme et tectonique des plaques. 1998. Ellipses. 256 p.
WESTPHAL M., WHITECHURCH H., MUNSCHY M. La tectonique des plaques. 2003. Collection Géosciences GB Science Publisher. 307 p.

Articles scientifiques pour le thème 1B

BALLEVRE M. Groix : une île fossile. Pour la science. 2003, mars, pp. 72-79.
GURNIS M. La sculpture des reliefs terrestres. Pour la science. 2001, mai, pp. 44-51.
HAZEN R. L’évolution des minéraux. Pour la science. 2010, juin, pp. 54-61.
LE MEUR H. Les Alpes battent en retraite. La recherche. 2003, juin, pp. 30-37.
LEMARCHAND F. La tectonique des plaques. La recherche. 2007, juin, pp. 50-55.
MATTAUER M. L’autonomie (géologique) de la Corse. Pour la science. 2001, août, pp. 76-78.
MATTAUER M. Coésite et formation des chaines de montagne. Pour la science. 2001, novembre, pp. 26- 29.
MATTAUER M. La tectonique des plaques. Pour la science. 2002, mai, pp. 70-75.
PHILIPPE MATTE La chaîne hercynienne reconstituée. Pour la science. 2003, septembre, pp. 58-63.
VANDERHAEGHE O. Les montagnes, des colosses au cœur tendre. Pour la science. 2009, janvier, pp. 34-40.

Sitographie pour le thème 1B

Sites généraux pour le thème 1B

- Planet terre : ressources en géologie, sciences de la Terre…
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre

Dont :
 • La diversité des ophiolites
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-diversite-desophiolites.
Xml

La fusion partielle et l’anatexie :
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/objets/img_sem/XML/db/planetterre/metadata/LOMImg324-
2010-09-13.xml

Principe de datation Rb-Sr, avec exemples :
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-datation-rubidiumstrontium.
Xml

Site riche en schémas, expériences, modélisations sur les phénomènes de divergence, convergence et subduction. Utilisable par les professeurs et les élèves.

Pétrographie pour le thème 1B

Logiciel de simulation, utilisation du microscope polarisant, suivi des roches lors de la subduction et fusion partielle de la péridotite. Utilisable par les élèves pour réviser leur cours.


Dont :
• Le Chenaillet : une excursion à travers une ophiolite de type LOT

• Série métamorphique du Haut-Alier et marqueurs de compression hercyniens :

- Le monde des ophiolites
http://ophiolite.free.fr

L’ophiolite d’Oman, son Log synthétique avec diaporama commenté, des photographies des différentes unités de l’ophiolite.

- Géologie et géochimie des massifs ophiolitiques de Saga et Sangsang de la zone de suture du Yarlung Zangbo, Tibet
http://archimede.bibl.ulaval.ca/archimede/fichiers/26079/26079.html

Sujet de thèse très complet, sur cette ophiolite, nombreuses illustrations…

Tectonique

- La formation des chaines de montagne
  • www2.ggl.ulaval.ca/personnel/bourque/intro.pt/planete_terre.html
Cours du département de géologie et de génie géologique de l’université Laval au Québec. Un cours d'introduction et de culture scientifique en Sciences de la Terre, accessible à tous, axé sur les grands et petits phénomènes qui affectent et régissent notre planète: dérive des continents, tectonique des plaques, …
Synthèse de plus d'un demi-siècle de recherches sur le terrain, ce film retrace l'histoire des Alpes françaises depuis l'époque carbonifère jusqu'à nos jours. Il s'attache en particulier à l'évolution représentée par les modifications subies par les terrains dans l'axe Gap-Briançon sous l'action des trois grands facteurs de toute orogenèse : sédimentation, plissement et érosion. 
  •  

- Sur la géologie Alpine

Nombreuses vidéos (formation des chaînes de montagne, formation de l’Himalaya, tectonique des plaques, expansion océanique, subduction…). Les commentaires sont en anglais.

- La subduction et l’obduction
www.geopedia.fr
Encyclopédie des sciences de la terre et du monde souterrain. Géologie, paléontologie, vulcanologie, archéologie, évolution des espèces, éclairage, taille de pierre, spéléologie, mines, carrières, catacombes et cartographie. De petits résumés pour différents cours de géologie. En particulier la subduction et l’obduction.

Isostasie et géodésie

- Des “fiches de cours” simples, illustrées et multilingues (Fr, En, De), principalement à destination des élèves (menu / item “Géodésie”) :
http://jabba.unil.ch/objectif-terre/index.php?id=3160

- Une petite histoire tectonique (très) résumée de la Terre (menu / item “Histoire de la planète”) :
www2.ggl.ulaval.ca/personnel/bourque/intro.pt/planete_terre.html

Des outils SIG

- Pages SIG du site SVT de Montpellier
http://svt.ac-montpellier.fr/spip/spip.php?rubrique5

Ce site présente les principes de bases de l’utilisation des globes virtuels type Google Earth et un certain nombre d’exemple d’utilisation en géologie.

- Application Google Earth pour les SVT
wwwpsvt.free.fr/svt/geol/google_earth/telecharger.htm
Il regroupe tout un ensemble de données recherchées sur différents sites. Il permet de télécharger des fichiers « layers », des dossiers « layers » (France,Alpes), des cartes géologiques et schémas structuraux, des documents dynamiques (tectonique), des dossiers d’intérêt géologique et pédagogique (volcanisme, tectonique, afars). Il permet de créer ses propres fichiers kmz.

- SIG géologique mondialisé
http://portal.onegeology.org ou http://onegeology.org/portal/home.html

Site permettant de créer de très nombreuses et variées cartes géologiques personnalisées (Âge des roches, etc) avec possibilité de les exporter en fichiers kmz (pour une exploitation secondaire sur GoogleEarth).


  • Thème 1B4 - La disparition des reliefs
- « Des différences entre les chaînes de montagnes récentes et anciennes » :

http://eduterre.ens-lyon.fr/eduterre-usages/terre/montagnes/differences
Une piste d’application pédagogique avec GGE et Mesurim

- Utiliser des images ou des données satellites pour qualifier et éventuellement quantifier l'érosion d'un massif actuel :

Ressources données satelites
 
Pistes péagogiques :

Bibliographie pour le thème 1B

Ouvrages généraux pour le thème 1B

-AMAUDRIC DU CHAFFAUT S. Tectonique des plaques, l’activité interne du globe terrestre et ses conséquences. 1999. Focus CRDP de l’Académie de Grenoble.188 p.
-CARON J.M. et al. Comprendre et enseigner la planète Terre. 2007. Ophrys éditions.303 p.
-DEBELMAS J. et al. Les grandes structures géologiques, 5ème édition. 2008. Dunod. 316 p.
-DERCOURT J. et al. Géologie, objets, méthodes et modèles, 12ème édition. 2006. Dunod. 532 p
-JOLIVET L. Géodynamique. 1998. Dunod. 226 p.
-MARSHAK S. Terre, portrait d’une planète. 2010. De Boeck Université. 833 p.
-MATTAUER M. Ce que disent les pierres. 1999. Bibliothèque Pour la Science.144 p.
-NICOLLET C. Métamorphisme et géodynamique. 2010. Dunod. 288 p.
-PEYCRU P. et al. Géologie, tout en un, 1ère et 2ème années BCPST. 2008. Dunod. 640 p.
-POMEROL et al. Éléments de géologie, 14ème édition. 2011. Dunod. 959 p.
-PROST A. La Terre, 50 expériences pour découvrir notre planète.1999. Belin. 124 p.

Ouvrages spécialisés pour le thème 1B

AVOUAC J. P., DE WEBER P. (ouvrage collectif). Hymalaya-Tibet, le choc des continents. 2002. Muséum national d’histoire naturelle, CNRS éditions.191 p.
BARDINTZEFF J.M. Volcanologie. 2011 Dunod. 313 p.
BONIN B., MOYEN J. F. Magmatisme et roches magmatiques, 3ème édition. 2011. Dunod. 313 p.
BRUNET F. et al. Roches et matériaux en conditions extrêmes. 2007. Vuibert. 202 p.
LALLEMAND et al. Convergence lithosphérique, société géologique de France. 2005. 182 p.
LALLEMAND S. La subduction océanique. 2007. Éditions scientifiques GB. 193 p.
MEHIER B. Magmatisme et tectonique des plaques. 1998. Ellipses. 256 p.
WESTPHAL M., WHITECHURCH H., MUNSCHY M. La tectonique des plaques. 2003. Collection Géosciences GB Science Publisher. 307 p.

Articles scientifiques pour le thème 1B

BALLEVRE M. Groix : une île fossile. Pour la science. 2003, mars, pp. 72-79.
GURNIS M. La sculpture des reliefs terrestres. Pour la science. 2001, mai, pp. 44-51.
HAZEN R. L’évolution des minéraux. Pour la science. 2010, juin, pp. 54-61.
LE MEUR H. Les Alpes battent en retraite. La recherche. 2003, juin, pp. 30-37.
LEMARCHAND F. La tectonique des plaques. La recherche. 2007, juin, pp. 50-55.
MATTAUER M. L’autonomie (géologique) de la Corse. Pour la science. 2001, août, pp. 76-78.
MATTAUER M. Coésite et formation des chaines de montagne. Pour la science. 2001, novembre, pp. 26- 29.
MATTAUER M. La tectonique des plaques. Pour la science. 2002, mai, pp. 70-75.
PHILIPPE MATTE La chaîne hercynienne reconstituée. Pour la science. 2003, septembre, pp. 58-63.
VANDERHAEGHE O. Les montagnes, des colosses au cœur tendre. Pour la science. 2009, janvier, pp. 34-40.

Sitographie pour le thème 1B

Sites généraux pour le thème 1B

- Planet terre : ressources en géologie, sciences de la Terre…
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre

Dont :
 • La diversité des ophiolites
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-diversite-desophiolites.
Xml

La fusion partielle et l’anatexie :
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/objets/img_sem/XML/db/planetterre/metadata/LOMImg324-
2010-09-13.xml

Principe de datation Rb-Sr, avec exemples :
http://planet-terre.ens-lyon.fr/planetterre/XML/db/planetterre/metadata/LOM-datation-rubidiumstrontium.
Xml

Site riche en schémas, expériences, modélisations sur les phénomènes de divergence, convergence et subduction. Utilisable par les professeurs et les élèves.

Pétrographie pour le thème 1B

Logiciel de simulation, utilisation du microscope polarisant, suivi des roches lors de la subduction et fusion partielle de la péridotite. Utilisable par les élèves pour réviser leur cours.


Dont :
• Le Chenaillet : une excursion à travers une ophiolite de type LOT

• Série métamorphique du Haut-Alier et marqueurs de compression hercyniens :

- Le monde des ophiolites
http://ophiolite.free.fr

L’ophiolite d’Oman, son Log synthétique avec diaporama commenté, des photographies des différentes unités de l’ophiolite.

- Géologie et géochimie des massifs ophiolitiques de Saga et Sangsang de la zone de suture du Yarlung Zangbo, Tibet
http://archimede.bibl.ulaval.ca/archimede/fichiers/26079/26079.html

Sujet de thèse très complet, sur cette ophiolite, nombreuses illustrations…

Tectonique

- La formation des chaines de montagne
www2.ggl.ulaval.ca/personnel/bourque/intro.pt/planete_terre.html
Cours du département de géologie et de génie géologique de l’université Laval au Québec. Un cours d'introduction et de culture scientifique en Sciences de la Terre, accessible à tous, axé sur les grands et petits phénomènes qui affectent et régissent notre planète: dérive des continents, tectonique des plaques, …


- Sur la géologie Alpine

Nombreuses vidéos (formation des chaînes de montagne, formation de l’Himalaya, tectonique des plaques, expansion océanique, subduction…). Les commentaires sont en anglais.

- La subduction et l’obduction
www.geopedia.fr
Encyclopédie des sciences de la terre et du monde souterrain. Géologie, paléontologie, vulcanologie, archéologie, évolution des espèces, éclairage, taille de pierre, spéléologie, mines, carrières, catacombes et cartographie. De petits résumés pour différents cours de géologie. En particulier la subduction et l’obduction.

Isostasie et géodésie

- Des “fiches de cours” simples, illustrées et multilingues (Fr, En, De), principalement à destination des élèves (menu / item “Géodésie”) :
http://jabba.unil.ch/objectif-terre/index.php?id=3160

- Une petite histoire tectonique (très) résumée de la Terre (menu / item “Histoire de la planète”) :
www2.ggl.ulaval.ca/personnel/bourque/intro.pt/planete_terre.html

Des outils SIG

- Pages SIG du site SVT de Montpellier
http://svt.ac-montpellier.fr/spip/spip.php?rubrique5

Ce site présente les principes de bases de l’utilisation des globes virtuels type Google Earth et un certain nombre d’exemple d’utilisation en géologie.

- Application Google Earth pour les SVT
wwwpsvt.free.fr/svt/geol/google_earth/telecharger.htm
Il regroupe tout un ensemble de données recherchées sur différents sites. Il permet de télécharger des fichiers « layers », des dossiers « layers » (France,Alpes), des cartes géologiques et schémas structuraux, des documents dynamiques (tectonique), des dossiers d’intérêt géologique et pédagogique (volcanisme, tectonique, afars). Il permet de créer ses propres fichiers kmz.

- SIG géologique mondialisé
http://portal.onegeology.org ou http://onegeology.org/portal/home.html

Site permettant de créer de très nombreuses et variées cartes géologiques personnalisées (Âge des roches, etc) avec possibilité de les exporter en fichiers kmz (pour une exploitation secondaire sur GoogleEarth).


Thème 2 - Enjeux planétaires contemporains

Seconde source de motivation des élèves pour associer les intérêts scientifiques fondamentaux et les préoccupations personnelles plus appliquées : l’environnement planétaire dans une perspective de développement durable pour le thème « grands enjeux planétaires contemporains » (avec, en plus de la préoccupation culturelle pour tous, une perspective vers l’univers métier de l’aménagement et de la gestion de l’environnement).


  • Thème 2A - Géothermie et propriétés thermiques de la Terre
Sens général du thème (problématique) : Comprendre que l’enjeu énergétique passe par la connaissance du flux thermique dont l’origine est interne.

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 2A - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 2A - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 2A - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive

 Des liens intéressants :

  • Thème 2B - La plante domestiquée
Sens général du thème (problématique) : Comprendre comment l’enjeu de la culture des plantes est passé et passe par l’action de l’Homme sur leur génome.

Thème 3 - Corps humain et santé

Troisième source de motivation des élèves pour associer les intérêts scientifiques fondamentaux et les préoccupations personnelles plus appliquées : le propre corps et la santé pour le thème « corps humain et santé » (avec en plus de la préoccupation culturelle pour tous, une perspective vers l’univers-métier des professions de la santé).






Thème 3A - Le maintien de l'intégrité de l'organisme : quelques aspects de la réaction immunitaire

Préambule :

Tout au long du lycée, le thème 3 amène à comprendre le fonctionnement de l'organisme humain et la nécessité d'un équilibre interne, l'homéostasie. Le thème 3-A permet ici non seulement une étude physiologique de l'immunité, garante de l'homéostasie, mais aussi de mener une réflexion plus large sur les enjeux et les responsabilités en matière de santé aux niveaux individuel, familial et collectif. Cette thématique est en outre l'occasion de présenter les métiers du domaine médical.

Cette réflexion sur la santé suppose des connaissances scientifiques solides, sans pour autant chercher l'exhaustivité des détails des mécanismes biologiques, parfois très complexes, mis en jeu. Cette étude du système immunitaire est d'ailleurs placée dans le thème 3 « corps humain et santé », et non dans le thème 1, ce qui implique une approche qui n'est pas centrée sur la recherche fondamentale mais plus sur les applications de ces connaissances à l'humain. Le programme propose de consacrer 33 % de l'année au thème 3, comportant deux parties, soit environ 5 à 6 semaines pour le thème 3-A sans que cela soit un impératif.

Le maintien de l'homéostasie suppose, en plus du fonctionnement normal de l'organisme, de prendre en compte les agressions du milieu extérieur ou des dérèglements internes. On s'attachera à montrer à l'élève que le système immunitaire est constitué de deux grands ensembles : l'immunité innée et l'immunité adaptative, qui coopèrent pour préserver la bonne santé de l'individu. Dans une perspective évolutive, on exposera l'immunité adaptative, présente uniquement chez les Vertébrés, comme s'ajoutant à l'immunité innée, présente chez tous les Métazoaires. Cette immunité innée, bien que suffisante chez la plupart des espèces, ne développerait pas de « mémoire », au contraire de l'immunité adaptative. Les connaissances  scientifiques fondamentales portant sur le système immunitaire adaptatif ont permis de développer la vaccination qui entraîne la formation de cellules mémoires à longue durée de vie. L'immunité innée   participe également à l'efficacité vaccinale, notamment en préparant l'organisme à la réaction adaptative grâce aux adjuvants. On montrera enfin que la stratégie vaccinale a le triple objectif de prévenir les maladies individuelles, les épidémies et finalement d'éradiquer les agents pathogènes.

Les avancées récentes dans le domaine de l'immunologie ont conduit à revoir certains concepts et on veillera à ne plus utiliser certains termes, qui d'ailleurs n'apparaissent plus dans le programme. Comme déjà précisé dans l'ancien programme, on ne parle plus d'immunité spécifique ou non spécifique depuis, entre autres, la découverte des récepteurs de l'immunité innée (PRR) et de leurs spécificités vis à vis de certaines structures moléculaires des pathogènes. On évitera le terme d'immunité acquise ; le terme d'adaptatif est plus riche de sens car il met en avant l’adaptation de notre système immunitaire à notre environnement infectieux. De plus, les termes de soi et de non-soi sont difficiles à utiliser car on ne peut pas les définir sans approximation. Au niveau cellulaire, le nom de granulocytes sera préféré à celui de polynucléaires, encore utilisé en médecine, mais source de confusion pour les élèves puisque ces cellules ne sont pas plurinucléées.

A l’école primaire, les élèves ont été sensibilisés à l'hygiène. Ce thème est repris et explicité en classe de troisième où les élèves sont conduits à un premier niveau de compréhension des réactions qui permettent à l'organisme de se préserver des pathogènes provenant de son environnement.

Le système immunitaire est traité en troisième dans un thème dédié, intitulé "Risque infectieux et protection de l'organisme" et présenté dans le Bulletin officiel spécial n° 6 du 28 août 2008, il représente 25% des séances de SVT soit une douzaine d'heures. Les élèves apprennent que nous sommes confrontés à un environnement peuplé de microorganismes, dont certains sont pathogènes et susceptibles de contaminer puis d'infecter l'organisme en traversant les barrières naturelles. Quelques éléments de lutte contre ces microbes ont été vus, comme les pratiques d'antisepsie et d'asepsie qui permettent de limiter les risques. Les élèves sont enfin amenés à comprendre le rôle des antibiotiques qui sont efficaces uniquement contre les bactéries.

Le système immunitaire proprement dit est ensuite abordé, sans distinction de phase dans la réponse immunitaire, sans inventaire des organes immunitaires et sans notion de coopération cellulaire.

On distingue en classe de troisième une réaction cellulaire rapide, la phagocytose, le plus souvent suffisante, réalisée par certains leucocytes mais sans citer le terme de « réaction inflammatoire ». On voit que d'autres leucocytes sont spécifiques d'un antigène et se différencient surtout dans les ganglions lymphatiques. On différencie les lymphocytes B qui sécrètent des anticorps, participant à l'élimination des micro-organismes et les lymphocytes T qui détruisent les cellules infectées par contact cellulaire direct.

Par ailleurs, la dernière partie du programme de troisième : « Responsabilité humaine en matière de santé et d’environnement » traitée dans une démarche de projet, a pu être l'occasion d'établir les conditions de réalisation de transfusion et de greffe en lien avec les connaissances acquises en immunologie.


Sens général du thème (problématique) : Comprendre que la bonne santé d’un individu résulte de réactions immunitaires, base d’un équilibre dynamique, développées en réponse à des dérèglements internes ou à des agressions du milieu extérieur.


  • Thème 3A1 - La réaction inflammatoire : un exemple de réponse innée 

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 3A1 - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 3A1 - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 3A1 - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive
Thème 3-A-1 La réaction inflammatoire : un exemple de réponse innée

Intentions, commentaires et limites

Il peut être bon dans cette partie de rappeler le rôle de l'anté-immunité ou « défenses naturelles », constituée de barrières :
• mécaniques (revêtement cutanéo-muqueux, flux d'air et de liquide, péristaltisme intestinal, mouvements ciliaires…),
• physicochimiques (acidité gastrique, certaines enzymes comme la pepsine ou le lysozyme, peptides antibactériens)
• écologiques (flore microbienne commensale, par compétition et par excrétion de substances antimicrobiennes).

L'immunité innée est présente dès la naissance et ne nécessite pas d'apprentissage (d'où le terme d' « innée »). Ses caractères sont hérités génétiquement et elle intervient de façon très rapide lors d'un signal de danger. On traitera uniquement la réaction inflammatoire localisée, sans décrire les effets sur la matrice extracellulaire et son remodelage, ni les mécanismes de régulation de l'inflammation. La réaction inflammatoire aiguë systémique (choc septique, syndrome de défaillance multiviscérale...) et ses mécanismes ne sont pas au programme. L'intérêt des élèves pourra être suscité par l'application des connaissances de l'inflammation à la médecine et à la pharmacologie, en étudiant les modes d'action de médicaments anti-inflammatoires sans rechercher l'exhaustivité.

Avec le souci de placer les élèves dans une démarche d’investigation, on montrera le caractère essentiel de l'immunité innée en s'appuyant par exemple sur les activités proposées. On pourra utiliser comme fil directeur les étapes qui suivent une contamination comme l'exemple de l'intrusion d'une épine.

L'opsonisation et le rôle du complément ne sont pas au programme. Les organes lymphoïdes secondaires pourront être abordés lors de la présentation des antigènes par les cellules dendritiques dans la deuxième partie.

Compléments scientifiques


Ce paragraphe a pour objectif d’apporter des compléments scientifiques au professeur sur certaines thématiques, mais les contenus développés ne sont en aucun cas exigibles de la part des élèves.

A propos des PAMP et des PRR

Suite à une blessure, un pathogène pénètre dans l’organisme via la peau ou les muqueuses. Dès son entrée, il est reconnu par les cellules de l'immunité innée comme les cellules dendritiques, les macrophages, les granulocytes, les mastocytes. Ces cellules sont capables d’identifier les pathogènes, grâce à des récepteurs qui reconnaissent des motifs moléculaires caractéristiques des micro-organismes. En 1989, l'immunologiste Charles Janeway Jr a proposé les termes de PRR (Pattern Recognition Receptor) pour les récepteurs cellulaires capables de reconnaître des motifs moléculaires caractéristiques des pathogènes appelés les PAMP (Pathogen Associated Molecular Pattern).

Les PAMP sont des molécules accessibles et souvent très représentées sur les micro-organismes. Ils sont très conservés au cours de l'évolution car indispensables à la survie des micro-organismes et ils n'existent pas sur les cellules humaines saines. Chaque groupe de micro-organismes possède un certain nombre de PAMP caractéristiques. Par exemple, un ARN double brin ou des fragments d’ADN non méthylés sont caractéristiques des virus, les mannanes sont des constituants importants des champignons, le lipopolysaccharide (LPS) est typique des parois des bactéries Gram négatif.

Les PRR sont exprimés par toutes les cellules de l'immunité innée et chaque type cellulaire en possède un certain jeu. Tous les PRR ne sont pas membranaires, certains sont cytoplasmiques, d'autres dans des endosomes. Ces localisations différentes et le nombre important de récepteurs permettent de contrer une grande partie des stratégies d'évitement développées par les micro-organismes. Au niveau fonctionnel, on distingue ceux qui permettent la phagocytose et ceux qui permettent l'activation des cellules. Les PRR sont très divers et on en décrit chaque année de nouveaux. On les réunit en grandes familles comme les récepteurs scavengers, les récepteurs de la famille des lectines, les récepteurs de la famille de pentraxines, les Toll Like Receptor (TLR)...

A propos du lien entre l'immunité innée et adaptative

L’immunité innée et l’immunité adaptative sont intimement liées.
L’activation des cellules de l’immunité innée et surtout des cellules dendritiques par les PRR fournissent au système immunitaire un « signal de danger » qui va induire le développement de la réponse immunitaire adaptative en activant les lymphocytes T. Sans ce signal de danger, la réponse immunitaire ne se met pas en action. Ce système évite, en théorie, toute réaction contre les propres constituants de l’organisme ou contre des molécules qui ne présentent pas de danger pour l’organisme. Ce signal de danger permet de rendre « immunogènes » (c’est-à-dire capable d’induire une réponse immunitaire) les micro-organismes ou molécules pénétrant dans notre organisme. Cette notion sera reprise par la suite (partie 3-A-3) car les adjuvants des vaccins ont pour fonction de mimer ce signal de danger. De plus, l’immunité adaptative utilise les armes de l’immunité innée pour détruire les pathogènes. Par exemple, les anticorps favorisent la phagocytose en se fixant sur les pathogènes (opsonisation) ou activent la voie classique du complément.

A propos des médicaments anti-inflammatoires

L’inflammation a pour but de reconnaitre, détruire et éliminer les pathogènes. Mais parfois la réaction inflammatoire dépasse ses objectifs et produit des effets gênants voir délétères. Lors de l'intrusion de micro-organismes, les macrophages, les cellules dendritiques et les mastocytes produisent de nombreux médiateurs cellulaires pour déclencher et stimuler la réponse inflammatoire, comme l'histamine, les cytokines proinflammatoires (IL-1, IL-6, TNF-α...) et des éicosanoïdes (molécules dérivées de l'oxydation d'acides gras à 20 atomes de carbone, prostaglandines, thromboxane, prostacycline, leucotriènes).

Certains marqueurs biologiques sont utilisés en médecine pour détecter ou suivre une réaction inflammatoire chez un patient comme :

• la vitesse de sédimentation des hématies (VS) : cette vitesse est dépendante, entre autres, de charges négatives à la surface des globules rouges. Certaines protéines de l’inflammation, dont le fibrinogène, inhibent ces charges et favorisent l’agrégation des hématies, augmentant la VS.
• la protéine-C-réactive (CRP) : il s'agit d'une protéine de la réaction inflammatoire d'origine hépatique dont la synthèse est contrôlée par l’IL-6. Lors d'une inflammation la CRP augmente de façon précoce. Sa demi-vie est courte, (8 à 12 h) ce qui permet, par comparaison de la cinétique de la VS et de la CRP, d'apprécier à quel moment de la réaction inflammatoire le patient se situe.

Lors de l'inflammation, de l’acide arachidonique est libéré à partir des phospholipides membranaires des cellules inflammatoires sous l’action des phospholipases A2. Deux types d’enzymes interviennent sur le métabolisme de l’acide arachidonique (figure 1) et permettent la formation d'éicosanoïdes :

Schéma à insérer : cf « ressources immuno » p6 du pdf
Figure 1 : Voies de synthèse des éicosanoïdes
(ou : trouver l’équivalent sur internet)


• les lipo-oxygénases qui induisent la formation des leucotriènes.
• les cyclo-oxygénases (Cox 1 et 2) qui génèrent la formation des prostaglandines et des thromboxanes. Une de ces cyclo-oxygénases, la Cox2, est dite inductible et n’est active que lorsque les phagocytes sont exposés à un processus inflammatoire.

Des substances médicamenteuses ont été mises au point afin de limiter ces effets, ce sont les anti-inflammatoires. Leurs actions permettent de bloquer le déclenchement de la réaction inflammatoire ou de stimuler les mécanismes de rétrocontrôles négatifs.

On distingue principalement :

les corticoïdes qui inhibent la plupart des phénomènes immunitaires dont la production d'éicosanoïdes par inhibition de la phospholipase A2, des cytokines proinflammatoires, des mastocytes et donc de l'histamine. L’action anti-inflammatoire des glucocorticoïdes a été démontrée pour la première fois en 1948 par R.S. Hench pour le traitement de la polyarthrite rhumatoïde ce qui lui valut, avec le biochimiste E.C. Kendall, le prix Nobel de médecine en 1950. Leurs travaux sur les corticosurrénales a abouti à l'isolement de la cortisone. La corticothérapie repose aujourd’hui sur l’utilisation de dérivés de synthèse de l’hormone naturelle (prednisone, prednisolone, …) permettant d’accroître l’action anti-inflammatoire et de réduire les actions métaboliques.

Les glucocorticoïdes traversent librement les membranes cellulaires et se fixent sur un récepteur cytoplasmique spécifique qui appartient à la superfamille des récepteurs nucléaires aux stéroïdes. Après fixation, le complexe glucocorticoïde-récepteur migre vers le noyau et va agir directement sur l’ADN en se fixant sur des séquences spécifiques, dites GRE (Glucorticoid Response Element), intervenant ainsi dans la régulation de la transcription de certains gènes.

Les anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS) comme l'aspirine et l'ibuprofène mais aussi le naproxène, le ketoprofène, le diclofénac, l'acide niflumique, le tenoxicam... L'utilisation de substances anti-inflammatoires non stéroïdiennes est très ancienne et les grecs utilisaient déjà les feuilles du saule. L’acide salicylique fut utilisé pour la première fois en 1875 dans le traitement du rhumatisme articulaire aigu. D'autres molécules furent ensuite découvertes comme la phénylbutazone en 1946, l’indométacine et ibuprofène dans les années 1960. Leur mode d'action commun repose sur l'inhibition des cyclo-oxygénases et empêchent la formation des prostaglandines. Ces dernières augmentent la sensibilité aux stimuli douloureux et la température de référence dans l'hypothalamus, ce qui explique l'action antalgique et antipyrétique des AINS.

On évitera l’exemple du paracétamol, celui-ci n’étant pas prescrit comme anti-inflammatoire mais uniquement comme antalgique.

Exemples d’activités
 
• Exploiter une description clinique de réaction inflammatoire aiguë localisée, actuelle ou historique comme le célèbre : « rubor et tumor cum calore et dolore » de Cornelius Celsus au Ier siècle, pour définir le tableau des signes caractéristiques de l'inflammation.

• Réaliser un tableau comparatif des caractéristiques anatomiques en dehors et durant une réaction inflammatoire, à partir d'observations de coupes ou de documents histologiques permettant de révéler l'origine, au niveau tissulaire, des symptômes cliniques de la réaction inflammatoire aiguë.

• Identifier les types cellulaires principaux impliqués dans le processus inflammatoire (macrophages, mastocytes, granulocytes, cellules dendritiques) à partir d'observations microscopiques et de documents.

• Recenser quelques médiateurs chimiques de l'inflammation, responsables de l'augmentation de la perméabilité vasculaire, de la vasodilatation, de la fièvre et de la douleur. Devant le grand nombre de médiateurs solubles impliqués dans les réactions inflammatoires, on pourra par exemple citer :

l'histamine, amine stockée dans les granules des mastocytes et vasoactives, dont le nom est connu des élèves car étant la cible des anti-histaminiques, médicaments largement utilisés.

les prostaglandines, médiateurs lipidiques néoformés, libérées par les mastocytes et coresponsables de la vasodilatation, de la fièvre et de la douleur, et cibles des anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS).

les cytokines pro-inflammatoires (IL-1, IL-6 et TNF-α), libérées par les mastocytes et les macrophages et qui augmentent le recrutement et la production des cellules et molécules de l'immunité. Leur libération est inhibée par les corticoïdes.

• Exploiter des données cliniques pour découvrir les effets pathogènes ou du moins non souhaitables, de certaines réactions inflammatoires et comprendre l'intérêt de les stopper par voie médicamenteuse.

• Analyser des données sur l'action d'anti-inflammatoires non stéroïdiens (aspirine, ibuprofène) dans la voie de biosynthèse des médiateurs dérivant de l'acide arachidonique (prostaglandines, leucotriènes, thromboxanes) pour comprendre leurs effets. On peut travailler également sur des documents présentant le mode d'action des corticoïdes mais il est plus difficile à comprendre (ils agissent sur l'expression de certains gènes).

• Exploiter un texte relatant l'expérience historique de Metchnikoff (prix Nobel 1908) sur la découverte de la phagocytose, à laquelle on peut ajouter des images en MEB afin de caractériser ce mécanisme. De multiples animations, plus ou moins précises, existent et permettent à l'élève de mieux se représenter la dynamique du phénomène.

• Exploiter des données sur le système immunitaire durant le développement embryonnaire et néonatal (rôle du foie foetal, de l'allaitement...).

• Identifier à partir des travaux de Jules Hoffmann et Butler (prix Nobel 2011) par exemple des points communs entre la réponse immunitaire des insectes et la réponse immunitaire innée humaine.

Article :

• Analyser un texte sur la théorie du danger de Polly Matzinger (scientifique américaine iconoclaste dont les travaux ont contribué à une nouvelle approche du système immunitaire baptisée théorie du danger qui reconsidère le rôle de la reconnaissance du non soi comme fondement de la réponse immunitaire.

• Comparer des séquences génétiques de récepteurs de l'immunité innée tels que les récepteurs Toll (TLR), pour montrer la conservation de mécanismes de reconnaissance et d'action au cours de l'évolution.

Bibliographie, sitographie, ressources (thèmes 3A1)

Ressources générales sur l'immunologie (commun aux thèmes 3A1, 2, 3)

Ouvrages généralistes sur l'immunologie

« Ton étonnant système immunitaire », disponible en téléchargement sur le site de l’ @ssim (association des collèges des enseignants d’immunologie des universités de langue française) – ouvrage de vulgarisation écrit par la société japonaise d’immunologie- agréablement illustré, il s’adresse à un public scolaire :
www.assim.refer.org/portail/portail/nouveaux-liens_files/d91e86f0b0137644fded335e36bf09ef-81.html

-David Male, Yvan Roitt, Johnatan Brostoff et David B Roth - Immunologie - Ed. Elsevier Masson, collection Campus Référence, 2007 - 600 pages

-Eric Espinosa, Pascal Chillet et Salvatore Valitutti - Immunologie - Ed. Ellipses Marketing, collection parcours LMD, 2010 - 510 pages

-Abul K. Abbas, Andrew H. Lichtman - Les bases de l'immunologie fondamentale et clinique Elsevier Masson, 2008 - 283 pages

Ouvrages généralistes sur l'immunologie, de plus haut niveau

-Charles Janeway, Paul Travers, Kenneth Murphy et Mark Walport - Immunobiologie - Ed. De Boeck 3ème édition 2009 - 890 pages

-Thomas J. Kindt, Richard A. Goldsby, Barbara A. Osborne et Catherine Fridman Immunologie - Le cours de Janis Kuby - Ed. Dunod 6ème édition 2008 - 684 pages

-Abul K Abbas, Andrew H Lichtman, Shiv Pillai - Cellular and molecular immunology - Elsevier 6ème édition, 2010  566 pages

Revues généralistes

-Dossier Pour la Science : Les défenses de l’organisme, pp. 8-12, octobre-décembre 2000

Sites généralistes

-Site de l'ASSIM : www.assim.refer.org

C'est le site de l'association des collèges d'enseignants d'immunologie d'universités de langue française. On y trouve des cours d'immunologie de niveau universitaire, de nombreux liens, un onglet lycée qui contient des documents utilisables en classe, des exemples de progression d'enseignants de lycée.

Ressources pour le thème 3-A-1 : la réaction inflammatoire, un exemple de réponse innée

Ouvrages et articles

Extraits de livres :

-Cadet Rémi. - L'invention de la physiologie, Bibliothèque scientifique, Belin - Pour la Science Ed. 2008
Chapitre sur la défense de l'organisme : présentation de quelques découvertes scientifiques historiques comme la découverte de la phagocytose page 215 mais aussi les débuts de la vaccination où la mise en évidence des anticorps.

Articles de revues scientifiques :

-Dossier PLS : L'immunité innée - Pour la Science, juin 2008, n°368
Le dossier propose une série d'articles sur le sujet : Les lymphocytes γδ , Les récepteurs de l'immunité innée, Des cellules nées pour tuer et Les sentinelles de la peau, Immunité innée : un code ancestral.

-Luke 0'Neill, L'immunité innée : une alerte précoce, Pour la Science, octobre 2005, n° 336

-S. Ugolini et É. Vivier, Les tueuses de l’immunité innée, Pour la Science, juin 2003, n° 308

-D. Ferrandon, C. Hetru, J.-M. Reichhart et J. Hoffmann, L’immunité acquise : de la drosophile à l’homme,

-Dossier Pour la Science Les défenses de l’organisme, octobre-décembre 2000, pp. 8-12

-Viviane Thivent, Cocktail d'insectes sur ordonnance, La Recherche, avril 2005, n°385
L'article présente l'histoire d'Entomed, entreprise créée par Jules Hoffmann et qui cherche des peptides antimicrobiens d'insectes d'intérêt thérapeutiques.

-Loïc Mangin « Jules Hoffmann, médaille d'or 2011 du CNRS » (et prix Nobel)
www.pourlascience.fr/ewb_pages/a/actualite-jules-hoffmann-medaille-d-or-2011-dua-cnrs-27990.php
L'article présente une courte biographie et un résumé de ses recherches sur l'immunité innée. Deux documents peuvent illustrer le cours : une image 3D d'un récepteur TLR humain et la comparaison entre les voies de l’immunité innée de la drosophile et de la souris utilisant la voie TLR.

-Jean-Jacques Perrier « Un filet d'ADN pour des cellules kamikazes »
www.pourlascience.fr/ewb_pages/a/actualite-un-filet-d-adn-pour-des-cellules-kamikazes-26057.php
Des granulocytes neutrophiles explosent pour emprisonner d'un filet d'ADN et de protéines les microbes pathogènes. Le mécanisme en jeu est résumé dans l'article.

Principaux sites

Cours de niveau universitaire sur le sujet, relativement concis.

-Cours : Réaction inflammatoire : aspects biologiques et cliniques
www.medecine.ups-tlse.fr/DCEM2/module8/item112/texteI1.htm
Cours de médecine sur la réaction inflammatoire, les cellules et molécules impliquées ainsi que sur les principes généraux du fonctionnement des anti-inflammatoires (corticoïdes et AINS)

Autres Divers :



  • Thème 3A2 - L'immunité adaptative : prolongement de l'immunité innée

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 3A2 - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 3A2 - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 3A2 - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive
  10. TS 2013 - Logiciel Immunologie - Animation - Le maintien de l'intégrité de l'organisme : quelques aspects de la réaction immunitaire.
  11.  

  • Thème 3A3 - Le phénotype immunitaire au cours de la vie



Thème 3B - Neurone et fibre musculaire : la communication nerveuse

Préambule :

Préambule : du programme à sa mise en oeuvre

L’introduction de cette partie de programme (Neurone et fibre musculaire : la communication nerveuse) donne le cadre pédagogique : comment une observation clinique de réaction réflexe permet de tester l’intégrité du système neuromusculaire ?
Le problème du contrôle peut, lui, être formulé à partir d’observations de maladies neuro-dégénératives du système nerveux moteur mais aussi à partir des acquis de la classe de première sur l’organisation en aires du cerveau.

La découverte de la plasticité des aires motrices peut être motivée par ce qui a été vu en classe de première à propos de la vision mais aussi par l’observation de cas de récupération motrice.

La mise en relation des acquis de seconde ou de première S avec quelques faits comme des cas cliniques notamment, peut permettre d’introduire les trois problèmes scientifiques qui s’imposent dans cette partie de programme. La motivation du travail des élèves n’est pas à négliger, même en terminale S, car elle est le fil directeur de la recherche. Elle permet, par une présentation explicite des objectifs, la mise en oeuvre de tâches complexes. Il ne faut donc pas hésiter à présenter des documents nouveaux, dont de l’imagerie scientifique voire des résultats expérimentaux durant la phase de motivation (situation de départ) de la démarche, mis en perspective avec les acquis des élèves.

Sens général du thème (problématique) : Comprendre plus finement le système neuromusculaire en identifiant le fonctionnement sommaire du réseau neuronique, du cortex cérébral caractérisé par sa plasticité.

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive


  • Thème 3B1 - Le réflexe myotatique : un exemple de commande réflexe du muscle

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 3B1 - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 3B1 - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 3B1 - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive


  • Thème 3B2 - De la volonté au mouvement

  • Thème 3B3 - Motricité et plasticité cérébrales

  

  • Thème 1 - La Terre dans l'univers, la vie et l'évolution des êtres vivants : énergie et cellule vivante 
  • ou :
  • Thème 1 - Énergie et cellule vivante.
Énergie et cellule vivante : on se limite aux cellules eucaryotes.

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 1 Spécialité - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 1 Spécialité - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 1 Spécialité - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive
 

Préambule

La problématique à traiter dans le cadre du thème 1 du programme de spécialité interroge les modalités cellulaires du flux d’énergie dans les systèmes vivants. Elle identifie des couplages dans lesquels l’ATP joue un rôle majeur. Son traitement s’appuie sur des acquis épistémologiques construits les années précédentes et nécessite de maîtriser quelques bases scientifiques.

Les bases épistémologiques

En classe terminale, le parcours scolaire et personnel de l’élève lui permet de disposer d’éléments d’information établis dans la perspective de comprendre le monde dans lequel il vit. Scolairement, cette compréhension a fait appel à de nombreuses reprises au concept d’énergie aussi bien en sciences de la  vie et de la Terre, qu’en physique-chimie et en technologie. La mise en cohérence préalable de ces connaissances est nécessaire à l’approche de la problématique de ce thème. Elle permet l’ancrage de connaissances déjà mémorisées et l’ouverture sur un questionnement plus approfondi.

Abordées en SVT

Les composants des systèmes vivants se transforment en permanence. Ces transformations sont source  d’effets repérables à différentes échelles. Ainsi, à l’échelle de la biosphère, les êtres vivants interviennent dans le cycle du carbone, du dioxygène ou de l’eau. A l’échelle des écosystèmes, la  matière est transformée au sein des réseaux trophiques. A l’échelle des organismes, les différentes fonctions sont réalisées grâce à des processus spécifiques de la vie. Enfin, à l’échelle cellulaire se déroulent diverses réactions métaboliques.

A l’origine de ces transformations, diverses formes d’énergie peuvent être identifiées. Il s’agit de l’énergie lumineuse provenant du soleil et de l’énergie chimique.

Les végétaux chlorophylliens nécessitent de l’énergie solaire pour synthétiser leur propre matière grâce à la photosynthèse. Cette matière est utilisée par les organismes non chlorophylliens. Les échanges gazeux respiratoires présents chez nombre d’organismes sont un indice d’une libération d’énergie chimique à partir de la matière. La contraction musculaire met en oeuvre une énergie mécanique. Il existe ainsi, à l’échelle de la biosphère et des écosystèmes, un flux énergétique intimement lié aux cycles de la matière permettant de passer de l’énergie lumineuse à l’énergie chimique et mécanique.

Abordées en physique-chimie

Le thème « Énergie et cellule vivante » remobilise des notions abordées dans le programme de physique-chimie de première S dans les deux domaines suivants.

Matière et énergie : Énergie chimique libérée (lors d’une combustion), formes d’énergie et principe de conversion d’énergie, stockage et conversion de l’énergie chimique, réaction d’oxydoréduction.

Lumière et matière : Émission, absorption, énergie d’un photon, spectre solaire, caractéristiques des molécules organiques colorées. Cet aspect est complété en terminale S par une partie consacrée à l’analyse spectrale.

Les fondements scientifiques

« Tout système vivant échange de la matière et de l'énergie avec ce qui l'entoure. Il est le siège de couplages énergétiques. »

La cellule apparaît comme un système vivant échangeant matière et énergie avec son environnement, il est assimilable à un système thermodynamique ouvert.

Différentes catégories de cellules peuvent être distinguées en fonction des molécules et des formes d’énergie qu’elles échangent avec leur environnement.

Les cellules chlorophylliennes présentent la capacité d’utiliser de l’énergie lumineuse afin de synthétiser des molécules organiques à partir de molécules minérales. L’énergie lumineuse est convertie en énergie chimique (conversion photochimique). L’étape clef en est un couplage photochimique impliquant la chlorophylle.

Utilisant l’énergie lumineuse comme source d’énergie, ces cellules chlorophylliennes sont phototrophes.
Elles font entrer l’énergie dans la quasi-totalité des écosystèmes terrestres. Utilisant le CO2 en tant que source de carbone, elles sont autotrophes pour le carbone

L’entrée d’énergie dans les autres cellules eucaryotes s’effectue directement sous forme chimique. Ces autres cellules sont chimiotrophes. Utilisant des molécules organiques pour produire leurs propres molécules organiques, elles sont hétérotrophes pour le carbone.

Toutes les cellules, qu’elles soient photosynthétiques ou non, oxydent les molécules organiques récupérant ainsi de l’énergie chimique pour produire de l’ATP. Différentes formes de couplages sont mis en jeu (couplage chimiochimique, chimioosmotique et osmochimique). Seule l’implication de couplages chimiochimiques figure au programme.

L’ATP ainsi produit est une forme d’énergie chimique utilisable pour toutes les activités cellulaires, ceci grâce à différents types de couplages.

Par exemple, dans la cellule musculaire, l’énergie chimique de l’ATP est convertie en mouvement ou énergie mécanique grâce à un couplage chimiomécanique impliquant des protéines motrices.

Les transferts d’énergie dans les cellules s’opèrent donc grâce à des couplages dont trois types sont abordés dans le cadre du programme : couplages photochimique, chimiochimique et chimiomécanique.

Schéma récapitulant les couplages énergétiques présentés dans le cadre du programme (cf «  ressources ») :
Site :
PDF (page 3/8) :
http://cache.media.eduscol.education.fr/file/SVT/03/7/Energie_et_cellule_vivante_220037.pdf


Supports pour l’investigation

Typologie des activités proposées :

[Hist] : Démarche historique
[Exp] : Démarche expérimentale
[Obs] : Démarche d’observation
[Doc] : Démarche documentaire
[Num] : Outils numériques

Comprendre l’entrée de l'énergie lumineuse dans les systèmes vivants : la photosynthèse

Repérer le processus et identifier les structures impliquées

[Hist] Suivi des marquages isotopiques du carbone (CO2) afin de repérer son devenir.

[Exp] Suivi des échanges d’O2 et de CO2 par ExAO (ou autres méthodes) afin de repérer le lien entre consommation du CO2, production d’O2 et photosynthèse.

[Exp] Coloration par de l’eau iodée de feuilles exposées ou non à la lumière durant plusieurs heures (expérimentation sur des feuilles panachées, Coleus, Géranium) afin d’identifier le lien entre besoin de lumière, de chlorophylle et synthèse d’une molécule organique : l’amidon.

[Obs] Observation microscopique de feuilles (coupe de feuille fraiche, feuille d’Élodée) afin de préciser la localisation de la chlorophylle dans les cellules chlorophylliennes.

Innovations techniques [1]

Lampe halogène à hauteur réglable

Préciser les structures cellulaires concernées et les molécules impliquées

[Doc] Observation d’électronographies de chloroplastes afin de repérer leur microstructure.

[Doc] ou [Obs] Observation de feuilles d’Elodée colorées à l’eau iodée au microscope optique afin de localiser la synthèse d’amidon.

[Exp] Réalisation d’une chromatographie d’un extrait de feuilles, sur papier ou sur colonne, afin de connaître la nature de la chlorophylle brute.

[Exp] Réalisation d’un spectre d’absorption d’une solution de chlorophylle brute afin de repérer ses propriétés vis-à-vis de la lumière.

[Exp] Réalisation de spectres d’absorption des pigments séparés par chromatographie afin de repérer la contribution des différents pigments dans le spectre d’absorption total.

[Exp] ou [Doc] Étude expérimentale (ExAO) de l’intensité photosynthétique en éclairant avec différentes radiations lumineuses afin de déterminer l’efficacité photosynthétique des radiations absorbées par les  pigments.

[Num] Étude de la structure des molécules impliquées dans le métabolisme (ATP, ADP, NAD, NADH) avec  un logiciel de modélisation moléculaire pour comprendre leurs propriétés.

Innovations techniques

Spectrophotomètre relié par USB [2]
Éclairage monochromatique sur lampe halogène à hauteur réglable [3]
Amplificateur d’électrode avec utilisation d’un pH mètre en tant que sonde à CO2 [4]
Enceinte cellulaire à miroir et éclairage LED [5]
Ampoules LED 16 couleurs et haute luminosité [6]

Dévoiler le processus métabolique

[Hist] Étude de résultats expérimentaux (Expérience de Gaffron), afin de repérer les modalités d’action de la lumière sur le processus photosynthétique.

[Hist] Étude de résultats expérimentaux (Expérience d’Arnon) afin de préciser la localisation de chaque phase et la nature des molécules produites

[Exp] et [Hist] Expérimentation ExAO : Expérience de Hill sur des thylakoïdes isolés afin de repérer les modalités du processus photosynthétique à ce niveau d’organisation du chloroplaste ainsi que celles de l’oxydation de l’eau en O2.

[Hist] Comparaison de potentiels redox de couples redox mis en jeu. (Fe3+/Fe2+; O2/H2O ; R/RH2) pour repérer la nécessité de l’apport d’énergie lumineuse afin de comprendre l’oxydation de l’H2O en O2

[Hist] Étude de l’expérience de Calvin et Benson afin de repérer les molécules dans lesquelles s’intègre le carbone issu du CO2.

[Hist] Étude des expériences de Bassham et Calvin (suivi du Ru1-5bisP et de l’APG lors du passage à l’obscurité ou à un milieu sans CO2) afin de suivre le mécanisme d’incorporation du CO2.

Comprendre l'utilisation de molécules organiques afin de récupérer de l'énergie utilisable : la respiration cellulaire et la fermentation

Découvrir le devenir des molécules organiques source d’énergie

[Exp] Étude du métabolisme de parties chlorophylliennes et non chlorophylliennes d’un végétal en présence ou en l’absence de lumière par ExAO afin de repérer les types cellulaires concernés par le métabolisme respiratoire.

[Exp] Suivi du métabolisme chez la levure en conditions aérobie et anaérobie avec caractérisation et dosage des produits formés afin d’identifier le devenir d’une molécule organique substrat : le glucose.

[Exp] Suivi de la fermentation alcoolique d’une part et de la respiration d’autre part chez la levure en fonction de la nature ou de la concentration en substrat, de la température, du pH, de la disponibilité en O2 afin de déterminer les conditions d’une dégradation partielle et complète des molécules organiques.

[Hist] Recherche documentaire sur les découvertes principales de Pasteur à propos de la fermentation (en les resituant dans leur contexte historique).

[Num] et [Doc] Recherche documentaire sur les utilisations de la fermentation dans le domaine de  l’agroalimentaire (vins, cidres, bières, pains…).

[Exp] Modification des conditions d’une fermentation (panification, production de bioéthanol…) afin de comprendre les effets de l’environnement sur la réalisation des réactions métaboliques.

[Exp] Utilisation du modèle de la bactérie lactique afin de repérer les spécificités de cette dégradation partielle du substrat organique. [7]

Identifier les structures cellulaires concernées et les processus métaboliques en jeu

[Doc] Observation comparée d’électronographies de cellules de levures en aérobiose et anaérobiose afin d’interroger les différences entre les organites les constituant.

[Exp] Mesure de l’efficacité respiratoire de différents substrats chez la levure et sur des mitochondries isolées par ExAO afin de repérer les modalités du processus respiratoire.

[Exp] [Hist] Transposition en ExAO de certaines expériences historiques de Krebs sur des mitochondries isolées afin de préciser le processus respiratoire, par exemple :

• Action du succinate, malate, oxaloacetate : activation de la respiration.
• Action du malonate (inhibiteur de l’oxydation du succinate en fumarate) : inhibition de la respiration.

[Exp] [Hist] Utilisation de poisons métaboliques afin de déterminer l’ordre d’intervention des complexes  dans le fonctionnement de la chaîne respiratoire.

[Exp] Extraction et dosage de l’ATP (bioluminescence - luciférase) de levures placées dans différentes conditions pour repérer et quantifier la production d’énergie par la cellule.

[Num] Étude de la structure des molécules impliquées dans le métabolisme (ATP, ADP, NAD, NADH) avec un logiciel de modélisation moléculaire pour comprendre leurs propriétés.

[Exp] Extraction et dosage par bioluminescence de l’ATP de levures placées en aérobiose et en anaérobiose pour quantifier comparativement la production d’ATP de la respiration et de la fermentation.

[Exp] Réalisation d’un extrait enzymatique de levures (possibilité de mutants) et caractérisation à l’aide d’une galerie API afin de repérer la diversité des enzymes impliquées dans le métabolisme.

Comprendre la réalisation d'une activité cellulaire source d’énergie mécanique : la contraction musculaire

Repérer l’énergie chimique dont disposent les cellules musculaires

[Exp] Recherche d’ATP dans un muscle de boeuf (steack) par bioluminescence (grâce au complexe luciférine – luciférase) pour repérer sa présence et le doser par utilisation d’une courbe-étalon. [8]

[Exp] Suivi de la contraction du muscle gastrocnémien de lombric par un microkinétomètre avant et après ajout d‘ATP afin de repérer sa nécessité dans la contraction. [9]

[Obs] Utilisation du modèle de la cyclose de chloroplastes en présence / absence d’inhibiteur de la production d’ATP (acide cyanhydrique) afin de relier utilisation d’ATP et mouvement.

[Doc] Étude de résultats expérimentaux sur la tension de myofibrilles en présence d’ATP et d’un inhibiteur de son utilisation (salyrgan) afin de repérer la nécessité de l’ATP pour la contraction.

[Doc] Suivi de la concentration musculaire d’ATP avant et après contraction afin de montrer le maintien de sa disponibilité.

Identifier les métabolismes permettant la mise à disposition d’énergie chimique aux cellules musculaires

[Doc] Étude de la variation de l’intensité respiratoire au cours d’un exercice à l’échelle de l’organisme afin de relier consommation d’O2 et énergie nécessaire à la contraction (cf programme de seconde).

[Doc] Observation d’électronographies de muscles. Comparaison de fibres musculaires lentes et rapides afin d’identifier les ultrastructures cellulaires impliquées.

[Doc] Suivi chronologique de la consommation de dioxygène afin de repérer les modalités de régénération de l’ATP.

[Exp] Recherche et dosage du glycogène musculaire afin d’interroger la présence de réserves énergétiques.

[Doc] Suivi des concentrations en glycogène dans la cellule musculaire afin de repérer l’utilisation de réserves énergétiques.

[Doc] Suivi des concentrations plasmatiques en acide lactique au cours de l’effort pour repérer une fermentation lactique au niveau musculaire.

[Doc] Suivi de la glycémie et des pressions partielles en O2 et CO2 dans les artérioles et veinules au  contact du muscle pour repérer la consommation de glucose et les échanges gazeux à l’effort, témoins de la respiration.

[Doc] Comparaison des propriétés des fibres rapides et lentes au cours de la contraction afin de les relier aux différentes voies de régénération de l’ATP.

Dévoiler le processus de conversion de l’énergie chimique en énergie mécanique

[Obs] Étude en microscopie optique de muscle cuit ou cru dilacéré ou de coupes transversales et longitudinales de muscle afin de repérer l’organisation structurale permettant la contraction musculaire.

[Doc] Étude en microscopie électronique de sarcomères dans une fibre relâchée ou contractée pour comprendre leur déplacement au cours de la contraction

[Num] Animation montrant les relations entre actine et myosine dans le cycle attachement / pivotement pour préciser le rôle de l’ATP dans les interactions moléculaires au sein des sarcomères et donc le couplage chimiomécanique.

Ressources documentaires

Bibliographie

- PRAT, Roger, Expérimentation en biologie et physiologie végétales, Hermann, 2007.
Ouvrage récent de protocoles expérimentaux notamment sur les pigments, respiration et fermentation,  photosynthèse.

- HELLER, René, et al, Physiologie végétale : Tome 1 Nutrition, Dunod, 2004.

- HOPKINS, Physiologie végétale, De Boeck, 2006.
Ouvrages de référence en physiologie végétale.

- FARINEAU et al., La photosynthèse : processus physiques, moléculaires et physiologique, Quae éditions, 2011.
Ouvrage très complet et actuel sur le sujet.

- POL, Didier, Travaux pratiques de biologie, Editions Bordas, 1994.
Protocoles expérimentaux.

- COSTILL, David, L. et al., Physiologie du sport et de l'exercice, Nathan,2006.
Adaptations physiologiques à l’effort.

- FLANDROIS, Roland, et al., Physiologie du sport, Masson, 2007.
Bases physiologiques des activités physiques et sportives.

- SALVIAT, Béatrice, et al., Biologie-Géologie APBG n°2 p271, 1997.
La respiration du muscle broyé : expériences de Krebs transposées pour l’ExAO.

- POL, Didier, Biologie-Géologie APBG n°1 p93, 1994
Un outil pédagogique original : la bioluminescence.

- BIGARD, André-Xavier - Pour la science, N°276, 2000.
L'adaptation du muscle à l'entraïnement.

Sitographie

Pages présentant le matériel d’expérimentation disponible chez les différents fournisseurs et des pistes d’activités expérimentales (numéros entre crochets)

Pages d’accès aux programmes du cycle terminal de la voie générale du lycée
http://eduscol.education.fr/pid23202-cid46522/programmes-du-cycle-terminal-de-la-voiegenerale.
html#serie_S%20term

Cours d’université sur la photosynthèse

Banque d’images pédagogiques CRDP Poitou Charente

Banque de schémas du site de l’académie de Dijon, partie consacrée à l’énergétique dont dispositifs et résultats expérimentaux .

Galeries API

Explications sur le métabolisme, photosynthèse et chloroplaste.

Différents expériences sur des mitochondries isolées (site en anglais)

Préparation de mitochondries isolées
www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/spip.php?article199

Protocoles sur l’utilisation du pyruvate par les mitochondries (ExAO)

Utilisation de succinate par les mitochondries (ExAO) et blocage par l’antimycine de la chaine respiratoire.
www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/spip.php?article273

Utilisation des fermentations en agroalimentaire

Les aliments fermentés

Informations sur le bioéthanol

Les travaux de Pasteur

Texte original « Études sur la bière » de Pasteur

Données sur le muscle et la contraction musculaire

Animations et logiciels

Feuille de calcul simulant les expériences consistant à mettre des substrats ou des bloquants à une préparation de mitochondries et à observer l'évolution de la teneur en O2 du milieu afin de retrouver la chaîne respiratoire. L'élève saisit la quantité de substance à mettre et le moment auquel il la met.

Informations sur les levures, diverses expériences virtuelles

Plugin CHIME

Logiciel RASTOP

Librairie de molécules en 3D

Animations actine – myosine du site de l’académie de Rennes
http://espace-svt.ac-rennes.fr/cartelec/cartelec_lyc/terminale_s/metabolisme/actine-myosine/actinemyosine.htm



  • Thème 2 - Enjeux planétaires contemporains : Atmosphère, hydrosphère, climats... du passé à l'avenir
  • ou
  • Thème 2 - Atmosphère, hydrosphère, climats : du passé à l'avenir.  

  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 2 Spécialité - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 2 Spécialité - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 2 Spécialité - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive

  • Thème 3 - Corps humain et santé : Glycémie et diabète
  • ou
  • Thème 3 - Glycémie et diabète  
  1. Programme (BO)
  2. Présentation ac-Nantes sur Padmyst Google Drive
  3. Présentation ac-Rouen sur Padmyst Google Drive
  4. Ressources Eduscol
  5. Ressources Eduscol sur Padmyst sur Google drive
  6. Thème 3 Spécialité - Ressources - PDF Ressources Eduscol
  7. Thème 3 Spécialité - Présentation - Ac Rouen 
  8. Thème 3 Spécialité - Présentation - Ac Nantes
  9. Réflexions - Ac Grenoble - Padmyst Google Drive

Thème 3 - Glycémie et diabète

Pistes d’activités envisageables

Autour de la notion d’enzyme

Origine alimentaire du glucose visant à faire émerger l’action des enzymes digestives

La notion d’enzyme = catalyse biologique, spécificité de substrat

Idées pour la classe
Ressources
• Concevoir et réaliser des protocoles expérimentaux sur la digestion de l’amidon.

• Concevoir et réaliser des protocoles expérimentaux sur la spécificité enzymatique.
• Expériences sur la digestion enzymatique, la notion de spécificité et l’influence de l’environnement :

www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/spip.php?article30

Le mode d’action des enzymes par la recherche d’explication à la spécificité de substrat = la nécessité d’un contact entre l’enzyme et son substrat

Idées pour la classe
Ressources
• Réaliser un TP ExAO de cinétique enzymatique (glucose, glucose oxydase).

• Utilisation d’une chaîne ExAO
fr/html/peda/svt/catalase/accueil.htm#KLINK
www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/spip.php?article120
www-peda.ac-martinique.fr/svt/tpenzy2.shtml

Les modalités du contact Enzyme-Substrat : le complexe [E-S] (la configuration tridimensionnelle d’une protéine enzymatique, le site actif, la complémentarité 3D E-S)

Idées pour la classe
Ressources
• Visualiser et comparer des molécules en 3D
• Utilisation de Rastop, jmol…
Échos de la science : diabète et obésité : une enzyme clé (N° 320, 05/1999)
Logiciel de simulation pour visualiser les complexes enzymesubstrat

Autour des notions de régulation ou d’homéostasie

La glycémie a une valeur globalement constante au cours de la journée malgré des apports discontinus (repas, jeûne). Il y a nécessité de maintenir constant ce paramètre (valeur réglée) pour le bon fonctionnement des cellules de l'organisme.

Les effecteurs de la glycémie

Idées pour la classe
Ressources
• Localiser le foie dans la circulation générale (notion : système porte hépatique)
• Localisation anatomique foie-pancréas, coupes histologiques foie – pancréas à différents grossissements :
• Réaliser les expériences foie lavé, muscle lavé
• Un protocole d’expérience du foie lavé : http://pedagogie.actoulouse.
fr/svt/serveur/lycee/iprnob/glycemie/html/protocole.htm
• Réaliser des expériences  de mise en évidence de glycogène dans le foie (test à l'eau iodée)
• Recherche du glycogène dans le foie :
• Mise en évidence et dosage du glycogène par ExAO (colorimétrie) : www.didier-pol.net/3MUSCLE2.html
• Recherche du glucose et du glycogène dans le foie :
www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/spip.php?article108
• Réaliser une préparation histologique de cellules hépatiques stockant glycogène
• Localisation foie-pancréas, coupes histologiques foie-pancréas :
• Extraire et exploiter des informations de textes  historiques :
Claude Bernard, expérience d'hépatectomie.
• Un catalogue de textes historiques (Claude Bernard) consultables en ligne (Bibliothèque universitaire de l’université Paris Descartes) :
www2.biusante.parisdescartes.fr/livanc/?cote=extulyonun6030&do=cha
pitre
• Les découvertes capitales du XXe siècle : du « principe » antidiabétique à l’hormone transgénique…
• Exploiter des documents montrant les principales voies métaboliques dans chaque tissu

• Mettre en relation avec la spécificité enzymatique :  équipement enzymatique des cellules hépatiques, musculaires et adipeuses.

• Calculer, à l’aide d’un  tableur, des bilans hépatiques avec ou sans perfusion de glucose.


Les capteurs de la glycémie

Les messagers hormonaux entre capteurs et effecteurs


Idées pour la classe
Ressources
• Observer des coupes histologiques de pancréas
• Coupes histologiques pancréas sain et diabétique :
fr/photo/histo_ani/pancreas/histo_pancr.htm
• Exploiter un texte historique sur l’hormone par Bayliss et Starling en 1905.

• Exploiter un texte historique sur la découverte de l’insuline par l’équipe de Banting en 1921 (prix Nobel 1923)

• Exploiter des tests d’immunofluorescence pour repérer cellules productrices d'insuline et de glucagon.

• Exploiter les expériences historiques de pancréatectomie (Von Mehring et Minkowski) + greffe + injections d’extraits pancréatiques.

• Exploiter des résultats expérimentaux de perfusions d’îlots de Langerhans par  concentrations variables de glucose.
• Fichier Excel montrant la relation entre la glycémie et le % de glycogène hépatique après ablation du pancréas :

• Schémas des expériences de Minkowski et Von  Mehring :
fr/site/spip.php?article416&id_document=897

• Modélisation de molécules 3D, dossier « hormones » : les hormones pancréatiques : http://pedagogie.actoulouse.
fr/svt/serveur/lycee/gutjahr/molec3D/serveur_molec3d/ac
cueil_doss.htm

• Mettre en évidence la forme d'une protéine pour aborder les relations hormone-récepteur et faciliter l'approche de certains phénotypes diabétiques : ww3.acpoitiers.fr/svt/ACTIVITE/JMC/INSULINE/Index.htm

Rôle des hormones sur les organes effecteurs

Idées pour la classe
Ressources
• Exploiter des expériences d’autoradiographie pour repérer des tissus cibles de chaque hormone.
• Schéma bilan du rôle de l’insuline sur ses tissus cibles :

• Effets de l’insuline et du glucagon sur le foie lavé :
www5.ac-lille.fr/~svt/svt/articles.php?lng=fr&pg=370
• ExAO pour mettre en évidence le rôle de l'insuline sur les cellules musculaires.
• ExAO - action de l’insuline sur les cellules musculaires :
fr/svt/act_ped/svt_lyc/prem/insuline/index.htm

Rétrocontrôle de type négatif et boucles hormonales antagonistes de régulation

Idées pour la classe
Ressources
• Réaliser une synthèse et construire les deux boucles de régulation antagonistes en cas d’hypo et d’hyperglycémie.
• Animations sur la régulation :

• Création d’un modèle de régulation de la glycémie :

• Lien Vensim ENS Lyon :

Autour des diabètes

Diagnostiquer le type d’un diabète

Idées pour la classe
Ressources
• Identifier les symptômes variables suivant les types de diabètes

• Exploiter des tests de glycémie à jeun et d’hyperglycémie retardée.
• Association française des diabétiques : www.afd.asso.fr

• Service de diabétologie :

Autour du Diabète Insulino-Dépendant (DID) ou Diabète de Type 1 (DT1)

Idées pour la classe
Ressources
• Saisir des données générales
Dossiers de l’INSERM (« Inserm actualités ») Rubrique : «Alimentation, métabolisme et nutrition. » Sous rubrique : « Diabète de type 1 (DID) »
dossiers-d-information/diabete-de-type-1-did

Comparer des lames histologiques de pancréas afin de détecter une cause possible de diabète

Idées pour la classe
Ressources
• Observer des lames microscopiques en TP (DT1)

• Etudier des photos de lames en ligne.

• Faire des captures numériques et les insérer dans un logiciel de présentation ou de traitement d’image.

• Suivant la qualité des lames/des images, comparer le diamètre des îlots de Langerhans voire évaluer le nombre de cellules contenues dans chacun d’eux.
• The Internet Pathology Laboratory For Medical Education (Images de différents tissus normaux et pathologiques) :

• Comparaison des coupes histologiques de pancréas d'un individu sain et d'un individu diabétique à différents
grossissements :
pancreas/compar/comp-loup.htm

L’aspect multifactoriel du déclenchement du diabète de type 1

Idées pour la classe
Ressources
• Étudier un exemple d'arbre généalogique dans une famille concernée par un diabète de type 1 lié aux allèles DR3 et DR4 d'un gène du CMH pour estimer le risque pour les enfants.

• Etude d’une induction virale (entérovirus).

• Réaliser un schéma fonctionnel.
• Enjeux méthodologiques de l’analyse de marqueurs génétiques dans les études d’association de maladies multifactorielles :

• Article du 18/03/2009 : Des virus à diabète? Des virus des intestins semblent impliqués dans le diabète :
20887.php

Autour du Diabète Non Insulino-Dépendant (DNID) ou Diabète de Type 2 (DT2)

Idées pour la classe
Ressources
• Saisir des données générales
Dossiers de l’INSERM (« Inserm actualités ») Rubrique : «Alimentation, métabolisme et nutrition. » Sous rubrique : « Diabète de type 2 (DNID) »
dossiers-d-information/diabete-de-type-2-dnid
• Utiliser des données épidémiologiques sur le diabète de type 2 à l’échelle mondiale
• Site de « Internationnal Diabetes Federation » www.idf.org/atlasmap/atlasmap

Contient une carte interactive présentant des données épidémiologiques chiffrées. (démographie, prévalence des diabètes, incidence des diabètes de type 1 chez les  jeunes, accès à une base de données pour 2011, accès à des données prédictives pour 2030).

Possibilité d’afficher les seules données intéressantes ;
Possibilité de sauvegarder les cartes générées sous différents formats (Jpeg et Png).

Origines génétiques et/ou environnementales du diabète de type 2

Idées pour la classe
Ressources
• Discuter des origines génétiques et/ou environnementales des perturbations de l’action de la mélatonine sur les cycles circadiens et par voie de conséquence sur le diabète de type 2.
• Article du 29 janvier 2012 : résumé de l’article «Rare MTNR1B variants impairing melatonin receptor 1B function contribute to type 2 diabetes»
ementary-information

• Principes d’anatomie et de physiologie, Tortora & Grabowski, DeBoeck Université, 3ème édition française, 2001. (p 628-629 = description du fonctionnement de la glande pinéale et de son implication sur le fonctionnement de la sécrétion de mélatonine entrainant la somnolence)
• Discuter des origines génétiques et/ou environnementales des perturbations de l'horloge rythmant les activités de nos cellules durant le cycle jour-nuit.
• Article du 01 juillet 2010 : Le diabète : un dérèglement du sens du temps ? l'horloge rythmant les activités de nos cellules durant le cycle jour-nuit semble impliquée dans le déclenchement du diabète de type 2, la forme de diabète la plus répandue.
du-sens-du-temps-25400.php
• Discuter des origines environnementales liées à des facteurs alimentaires.

• Discuter des origines  génétiques à partir des mutations touchant le gène du récepteur aux sulfamides, des molécules augmentant la sécrétion de l'insuline


Idées pour la classe
Ressources
Extraire des informations de publications scientifiques simplifiées de niveau adapté aux élèves pour :

• Réaliser un schéma fonctionnel présentant l’aspect multifactoriel du déclenchement du diabète de type 2 (carte heuristique).

• Mettre en relation les causes d’un diabète de type 2 avec des pistes de traitement théoriques.
Remarque : les notions présentées dans ces dossiers si elles sont proposées telles quelles aux élèves peuvent nécessiter des travaux de recherche complémentaires pour comprendre certains passages. Un bon exercice pour la préparation à l’enseignement supérieur.
• Dossiers « Inserm actualités » (IA) Rubrique : «Alimentation, métabolisme et nutrition. » Sous rubrique : « Diabète de type 2 (DNID) »
dossiers-d-information/diabete-de-type-2-dnid

Suivre les 3 liens en bas de page vers les dossiers « Inserm actualités » menant vers les articles suivants :

Gènes de prédisposition au diabète, une belle avancée! (IA n° 207, novembre-décembre 2007, 21-28.)

Dossier diabète de type 2. IA n° 197, mars 2006, p. 9-27.)
Contenant entre autre : Diabète - chronique d’une explosion annoncée- La cellule bêta, cette familière inconnue - Du labo vers la clinique : une vraie continuité - Génétique multifactorielle et génomique fonctionnelle.

Le diabète de type 2, juste un problème de  périphérie ? (IA n° 197, mars 2006, p. 32-34)

Autre diabète

Idées pour la classe
Ressources
• Comparer des séquences de gènes impliqués dans un diabète de type MODY (Maturity Onset type Diabetes of the Young)

Diabète ni de type 1 ni de type 2, monogénique avec transmission autosomique dominante de
survenue précoce et non insulinodépendant au début.

Pour le diabète MODY2, implication du gène de la glucokinase, enzyme impliquée dans la phosphorylation du glucose intracellulaire, 1ère étape conduisant au stockage sous forme de glycogène.
Fichier diabete.edi, utilisable avec ANAGENE et contenant :

ADN brin non transcrit glucokinase humaine « sauvage »
ADN brin non transcrit glucokinase humaine « mutation non sens sur la glucokinase »

• Département « Génomique et maladies métaboliques » de « Institut Pasteur de Lille - Institut de Biologie de Lille » équipe spécialisée dans les recherches sur les diabètes et dirigée par le Pr Froguel :
www-good.ibl.fr (voir le Volet « Grand public »)
• Inventer des dialogues, effectuer des jeux de rôles entre un patient diabétique de type 2 et son médecin qui le conseille sur son mode de vie.

• Créer une campagne de prévention.

• Faire venir en classe des professionnels de santé (infirmière ou médecin scolaire ou nutritionniste) qui permet de travailler sur la restitution, les prises de note …
• Dossier thématique : programme de  surveillance épidémiologique du diabète (avec un dossier type 1 et un dossier type 2) : www.invs.sante.fr/Dossiers-thematiques/Maladieschroniques-
et-traumatismes/Diabete
• Département « Génomique et maladies métaboliques » de « Institut Pasteur de Lille - Institut de Biologie de Lille » équipe spécialisée dans les recherches sur les diabètes et dirigée par le Pr Froguel :
www-good.ibl.fr (voir le Volet « Grand public »)

Bibliographie

Livres

- IDELMAN, Simon. Endocrinologie - Fondements physiologiques.PUF,1990.
- HAZARD, J. et ., PERLEMUTER, L. Abrégés endocrinologie. Masson, 1978
- HENNEN, G. Biochimie 1er cycle. Dunod, 2006.
- RIEUTORT, A. Physiologie animale: les grandes fonctions, tome 2. Masson, 1986.
- MARIEB, A. Anatomie et physiologie humaine. De Boeck
- RICHARD, D. et ORSAL, D. Neurophysiologie - organisation et fonctionnement du système nerveux. Dunod, 2007.
- RICHARD, D. et CHEVALET, P. La notion de régulation en physiologie. Université collection 128 : Nathan, 1999.
- CALVINO, B. L’introduction à la physiologie, cybernétique et régulations. Belin, 2003.
- HATEM, J, HERVE, J-C. Régulation de la glycémie. Hâtier, 1983.
- KRUH, J. : Biochimie, vol II Métabolismes. Hermann, 1989.
- BEAULIEU, KELLY Hormones. Hermann, 1990.
- PELMONT, J. Enzymes, catalyseurs du monde vivant. EDP Sciences,1995.
-Cinétique enzymatique. Collection Grenoble Sciences, 2012.

Revues

Pour la Science

- PLS n° 155 : « le développement du diabète »
- Un nouveau diabète de l’enfant : septembre 2006
- Le diabète du bébé : janvier 2008
- Diabètes thérapie par les cellules souches : mars 2008
- Diabètes d’alpha à beta : septembre 2008
- Diabètes un excès d’énergie : septembre 2010
- Un diabète d’origine maternelle : août 2011

Dossiers Pour la Science

- Les maladies émergentes : le diabète insulino-dépendant. PLS, octobre 1995


- N°437 - 01/2010 - Détourner des cellules pour soigner le diabète
- N°388 - 07/2005 - L'insuline, déclencheur du diabète
- N°418 - 04/2008 - Ces vaches qui fabriquent des médicaments
- N°418 - 04/2008 - Soigner le diabète par une greffe dans le bras »
- N°440 - 04/2010 - Vers un pancréas artificiel.

Autres articles de revues scientifiques

- CLOS, Jean et MULLER, Yves. Les réponses de l’organisme aux contraintes énergétiques ou la régulation de la glycémie revisitée. APBG, 2002 n°1, p. 143
- Diabète et obésité : une enzyme clé. Échos de la science, N° 320, 05/1999.

Sitographie

Ressources des sites académiques

- Sur le site SVT de l’académie de Rennes :
Contenu : présentation de microphotographies histologiques de pancréas, diabétique ou non, à différents grossissements.

Sites de ressources scientifiques

- Site de l’Inserm :
Contenu : accès à des dossiers thématiques sur les diabètes et d’autres thèmes autour du métabolisme et de la nutrition. (Remarque : pour chaque chapitre, en bas de page, de nombreux liens connexes au thème sont proposés)

- Site de l’Institut de Veille Sanitaire :
Contenu : dossier thématique présentant le programme de surveillance épidémiologique du diabète de l’Institut de veille sanitaire. Il contient des informations générales sur le diabète et détaille les principales caractéristiques du diabète (fréquence, complications, mortalité, qualité de la prise en charge médicale, qualité de vie…). Dans chaque sous-partie du dossier diabète, une brève description est proposée ainsi que des liens vers des diaporamas, des articles ou des sites internet proposant d’autres informations ou des compléments d'informations.

- Site du département « Génomique et maladies métaboliques » de « Institut Pasteur de Lille - Institut de Biologie de Lille » dirigé par le Pr Froguel Philippe :
www-good.ibl.fr
Contenu : un site riche avec un volet « Grand public » qui contrairement à ce que son intitulé laisse penser présente de nombreuses données scientifiques de bon niveau en lien avec le diabète.

- Sites pour approfondir les notions scientifiques sur les enzymes :
Contenu : un cours sur la catalyse enzymatique.

- Site Vie (Université Pierre et Marie Curie- Paris 6):
Contenu : dossier thématique « cybernétique et physiologie », par Gilles Furelaud et Bernard Calvino (Ecole supérieure de physique-chimie industrielle de Paris)avec un item homéostasie et cybernétique.
Voir aussi le complément : « Sous le terme rétroaction, désigne-t-on toujours la même chose ? », article de Jean-Claude Hervé avec trois exemples dont celui de la régulation de la glycémie.

Sites d’animations ou d’exercices en ligne

- Sur le site de l’académie de Nantes :
Contenu : animations de schémas permettant de comprendre le fonctionnement d’un système de régulation (choix possible : glycémie directe).

- Sur le site de l’académie de Créteil :
Contenu : une animation très complète sur le rôle du foie dans la régulation de la glycémie, par Laurent Martorell, professeur de biochimie

Logiciels

- Logiciel « Glycémie » (par François TILQUIN).
Contenu : Ce logiciel n’est qu’un modèle, et doit être utilisé en tant que tel. Cependant l’aspect dynamique et la complexité peuvent être abordés par le logiciel. Les acteurs de la régulation et le fondement d’une autorégulation sont les aspects fondamentaux que l’on peut aborder grâce au logiciel. »

- David ou l'éducation du malade diabétique. Editions : P.W.A
Contenu : Des connaissances de base sur le diabète et sur l'alimentation du diabétique. Le métabolisme des glucides. Qu'est-ce que le diabète. Pourquoi s'alimenter ? Les nutriments. Comment s'alimenter, Diététique et diabète. Théorie et pratique de l'insulinothérapie. Les hypoglycémiants oraux. L'auto surveillance du diabète. L'autocontrôle du diabète. La céto-acidose. Les hypoglycémies. Grossesse et diabète. Les complications.

- Logiciel ModSim Glycémie.
Contenu : ModSim Glycémie traite de la régulation de la glycémie par les hormones pancréatiques. Il permet la construction par l'élève d'un modèle fonctionnel et sa validation. L'élève sélectionne les éléments du modèle (foie, pancréas, intestin, muscles, rein, cellules nerveuses, cellules adipeuses, autres cellules) et détermine ses propriétés. Le modèle est ensuite éprouvé par confrontation avec des données expérimentales (ablations, test d'hyperglycémie provoquée...).

- Site du Logiciel de modélisation VENSIM PLE:
Contenu : Vensim est un logiciel de construction de modèles à compartiments. Il permet de construire des modèles (les outils pour construire les compartiments, déterminer les variables et visualiser les différents flux sont faciles d’utilisation)et c’est aussi un outil de simulation.
Une équipe de l’académie de Toulouse propose de créer le modèle de régulation de la glycémie :





TS 2013 - En vrac 2012 - 2013
TS 2012 - Divers 2011 - 2012